微生物學(xué)報(bào)Acta Microbiologica Sinica
48(7):851~856;4 July 2008
關(guān)統(tǒng)偉1,2,,吳晉元2,,職曉陽(yáng)2,,唐蜀昆2,,徐麗華2,,李文均2,張利莉1*
(塔里木大學(xué),,新疆兵團(tuán)塔里木盆地生物資源保護(hù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,,阿拉爾843300)
(云南大學(xué),云南省微生物研究所,,教育部微生物多樣性可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,,昆明650091)
摘要:【目的】認(rèn)識(shí)和了解鹽湖沉積環(huán)境中放線菌的多樣性,為今后的開(kāi)發(fā)和利用奠定基礎(chǔ),?!痉椒ā繎?yīng)用免培養(yǎng)技術(shù)和基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析對(duì)新疆硝爾庫(kù)勒鹽湖沉積物中放線菌的多樣性進(jìn)行了研究。實(shí)驗(yàn)采用SDS-CTAB法提取土樣中總DNA,,利用放線菌特異性引物對(duì)土樣總DNA進(jìn)行16S rRNA基因擴(kuò)增,,并構(gòu)建16S rRNA基因克隆文庫(kù),;對(duì)隨機(jī)挑選的160個(gè)克隆通過(guò)酶切篩選出51個(gè)不同圖譜的重組克隆,并對(duì)其測(cè)序,?!窘Y(jié)果】所獲得的51個(gè)克隆序列屬于39個(gè)OTUs,其中52.9%的克隆序列分布于放線菌門(phylum Actinobacteria)放線菌亞(Actinobacteridae)的5個(gè)亞目和酸微菌亞綱(Acidimicrobidae)中,,并且在這兩個(gè)亞綱中有大量克隆序列屬于放線菌的新類群,,另外47.1%的克隆序列以極高的自展值在放線菌門內(nèi)支持形成一個(gè)獨(dú)立的大分支,極有可能代表一個(gè)新亞目或更高級(jí)分類單元的類群,?!窘Y(jié)論】這些研究結(jié)果說(shuō)明硝爾庫(kù)勒鹽湖中存在有較為豐富的放線菌系統(tǒng)發(fā)育多樣性,并且潛藏著新類型的放線菌資源,。
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