微生物學(xué)報Acta Microbiologica Sinica
48(7):851~856;4 July 2008
關(guān)統(tǒng)偉1,2,吳晉元2,,職曉陽2,,唐蜀昆2,徐麗華2,,李文均2,,張利莉1*
(塔里木大學(xué),新疆兵團(tuán)塔里木盆地生物資源保護(hù)利用重點實驗室,,阿拉爾843300)
(云南大學(xué),,云南省微生物研究所,教育部微生物多樣性可持續(xù)利用重點實驗室,,昆明650091)
摘要:【目的】認(rèn)識和了解鹽湖沉積環(huán)境中放線菌的多樣性,,為今后的開發(fā)和利用奠定基礎(chǔ)?!痉椒ā繎?yīng)用免培養(yǎng)技術(shù)和基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析對新疆硝爾庫勒鹽湖沉積物中放線菌的多樣性進(jìn)行了研究,。實驗采用SDS-CTAB法提取土樣中總DNA,利用放線菌特異性引物對土樣總DNA進(jìn)行16S rRNA基因擴增,,并構(gòu)建16S rRNA基因克隆文庫,;對隨機挑選的160個克隆通過酶切篩選出51個不同圖譜的重組克隆,并對其測序,?!窘Y(jié)果】所獲得的51個克隆序列屬于39個OTUs,其中52.9%的克隆序列分布于放線菌門(phylum Actinobacteria)放線菌亞(Actinobacteridae)的5個亞目和酸微菌亞綱(Acidimicrobidae)中,,并且在這兩個亞綱中有大量克隆序列屬于放線菌的新類群,,另外47.1%的克隆序列以極高的自展值在放線菌門內(nèi)支持形成一個獨立的大分支,極有可能代表一個新亞目或更高級分類單元的類群,?!窘Y(jié)論】這些研究結(jié)果說明硝爾庫勒鹽湖中存在有較為豐富的放線菌系統(tǒng)發(fā)育多樣性,并且潛藏著新類型的放線菌資源,。
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