一篇很有趣的文章,,本文的核心算法在我們以前的關(guān)于進化樹構(gòu)建與評估的專題里曾有提及,,在這里編者再描述一下算法的思想以及本文的工作背景和意義,。重組是一個重要的進化事件,是影響基因和基因組“結(jié)構(gòu)”的重要因素,,并且在保持物種之間遺傳差異中起到主要作用,。因此,檢測重組事件收到廣泛關(guān)注,。重組事件的發(fā)生使得基因組(包括基因不同部分)之間的進化歷史的聯(lián)系和一致性收到破壞,,同時這也成為了指導重組事件識別的理論工具。一般來說,,現(xiàn)有的方法可以被分為兩類:第一類是對序列匹配之后的不同部分構(gòu)造進化樹,,然后比較這些樹的形狀和樹長方面的差異。在這方面使用最廣發(fā)的是bootscanning方法,;第二類方法的目標只是識別是否有重組事件的存在而不去識別重組事件的發(fā)生點(recombination breakpoints),,這種方法不需要針對不同部分構(gòu)造進化樹。這些方法都需要引入大量的計算,。本文的作者發(fā)展了一種新的,、在計算上代價較小的可視化方法來檢測重組事件是否發(fā)生,以及決定recombination breakpoints,。在某種程度上該方法可以堪稱是bootscanning和quartet-mapping方法的結(jié)合,。關(guān)于quart-mapping方法我們在以前有過介紹。在本文作者在去除背景噪音方面作了很多改進,,使得該方法能真正應用到實際研究中來,。