有越來越多的證據(jù)表明,，基因表達(dá)的動(dòng)力學(xué)特征較人們先前想象得更為復(fù)雜。對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的mRNA表達(dá)實(shí)施靈敏的快照技術(shù),，揭示出了在外部刺激缺乏的情形下基因表達(dá)產(chǎn)生的顯著的隨機(jī)時(shí)間變化特征,。

        活體檢測(cè)具有很多優(yōu)勢(shì),，尤其是當(dāng)你想了解實(shí)時(shí)的動(dòng)態(tài)變化時(shí)。然而,，有時(shí)侯要想獲得詳細(xì)的時(shí)間變化數(shù)據(jù),，通過進(jìn)行極為精確的快照測(cè)量要比進(jìn)行較少精確的活體記錄更為容易些。

        來自美國(guó)紐約大學(xué)和公共衛(wèi)生研究所的Arjun  Raj,、Sanjay  Tyagi和他們的同事采用這種策略發(fā)現(xiàn)了哺乳動(dòng)物細(xì)胞在大型的內(nèi)在隨機(jī)型脈沖狀轉(zhuǎn)錄活動(dòng)中發(fā)生了基因轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,。在以前的研究中，人們使用綠熒光蛋白法(GFP)和熒光顯微鏡法,，檢驗(yàn)了活的細(xì)菌或酵母中基因表達(dá)的時(shí)間動(dòng)力學(xué)特征,。這些研究間接證實(shí)，轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象呈脈沖狀發(fā)生,。取而代之的是,，MS2的RNA束縛蛋白質(zhì)的一系列束縛位點(diǎn)能夠被添加到某一目標(biāo)基因上。一種GFP-MS2融合蛋白可以穩(wěn)定地在細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá),，目標(biāo)mRNA水平上的變化可以通過查看GFP定位的改變來進(jìn)行觀測(cè),。這項(xiàng)技術(shù)為細(xì)菌中發(fā)生的適度脈沖狀轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象提供了證據(jù)。

        但是,，這些方法也有缺點(diǎn),。“熒光蛋白存在著問題，它們對(duì)實(shí)際發(fā)生的轉(zhuǎn)錄過程并不提供一種很好的指示特征,，”Raj評(píng)論說,。因?yàn)镚FP非常穩(wěn)定，它實(shí)際上代表著轉(zhuǎn)錄水平的一種動(dòng)態(tài)平均值,。雖然GFP-MS2束縛方法能提供有關(guān)mRNA的實(shí)時(shí)信息,，但它受到高背景值的干擾，也會(huì)影響試驗(yàn)的靈敏度,。

        Raj及其同事認(rèn)為,，他們能通過放棄活細(xì)胞成像法，轉(zhuǎn)而對(duì)整體混合的細(xì)胞中的mRNA分子進(jìn)行精確而靈敏的測(cè)定,，就可以克服上述缺點(diǎn),。他們?cè)趫?bào)告基因的3'端放置32條重復(fù)序列，然后把它們整合到哺乳動(dòng)物細(xì)胞的基因組之中去,。接著,，他們運(yùn)用包含有五種熒光團(tuán)的探針，進(jìn)行了RNA熒光原位雜交試驗(yàn)(FISH),。結(jié)果發(fā)現(xiàn),，他們能通過測(cè)量熒光顯微快照中單個(gè)的點(diǎn)，檢測(cè)到單個(gè)的mRNA,。Raj設(shè)計(jì)出了軟件,，來對(duì)這些FISH點(diǎn)進(jìn)行自動(dòng)識(shí)別并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,。

        也許有人會(huì)認(rèn)為，這對(duì)于判定基因表達(dá)的時(shí)間變化并不是非常有用,，但是，事實(shí)上它的功能相當(dāng)強(qiáng)大,。Raj說：“如果你假定,，細(xì)胞種群中所有單個(gè)細(xì)胞的快照點(diǎn)代表著該細(xì)胞隨時(shí)間而出現(xiàn)的實(shí)際情形的話，那么你就能從整個(gè)種群中推測(cè)出單個(gè)細(xì)胞的行為,。”

        他們發(fā)現(xiàn),，對(duì)于不同細(xì)胞來說，F(xiàn)ISH快照點(diǎn)變化很大,，這表明基因激活呈現(xiàn)了特別不協(xié)調(diào)的脈沖特征,。“活體成像對(duì)于這類研究來說，相比來說用途更少,，”Raj評(píng)論說,。“它的主要優(yōu)點(diǎn)在于，相對(duì)于其它方法來說,，它能發(fā)出更強(qiáng)的信號(hào),。”研究者應(yīng)用統(tǒng)計(jì)分析方法，獲得了轉(zhuǎn)錄脈沖的頻率和它們的平均值,。

        他們利用這種方法的高靈敏性,，來檢測(cè)一種內(nèi)源基因的表達(dá)，該基因包含有天然重復(fù)的序列,。由于把不同顏色的熒光團(tuán)添加到FISH探針上很容易,，他們甚至能夠把mRNA從多重基因中立即檢測(cè)出來。

        雖然,，在那個(gè)能對(duì)活細(xì)胞中單個(gè)mRNA進(jìn)行可靠檢測(cè)的圣杯制造出來之前,，在這一領(lǐng)域進(jìn)行方法學(xué)上的改進(jìn)仍有很大的想象空間，但這一研究工作表明,，把一些過時(shí)的技術(shù)和精細(xì)分析方法緊密地結(jié)合起來進(jìn)行應(yīng)用,，仍然能夠產(chǎn)生很好的效果。