由西班牙巴塞隆納超級(jí)計(jì)算機(jī)中心 (Barcelona Supercomputing Center)與該國(guó)國(guó)家生物信息研究院 (National Institute for Bioinformatics) 的科學(xué)家,共同在PNAS(Proceedings of the National Academy of Sciences) 期刊上發(fā)表一份論文指出,,該研究團(tuán)隊(duì)利用超級(jí)計(jì)算機(jī)輔助的運(yùn)算,,嘗試的了解復(fù)合蛋白質(zhì)的架構(gòu)過(guò)程,,而透過(guò)掌握蛋白運(yùn)作的過(guò)程,,將有助于了解蛋白質(zhì)體運(yùn)作的真相,,輔助藥物的設(shè)計(jì),。
據(jù)了解這個(gè)稱為 MoDel (Molecular Dynamics Extended Library)研究計(jì)劃的主要目的,,是希望透過(guò)運(yùn)作動(dòng)力學(xué) (dynamic)的模式,,了解復(fù)雜蛋白質(zhì)復(fù)合體的活動(dòng)情形,,架構(gòu)出蛋白結(jié)構(gòu)信息的第四度 ('fourth dimension)空間信息,未來(lái)生物藥學(xué)的研究人員,,就可以清楚的掌握,,具有活性分子的蛋白質(zhì)行為,獲得最佳藥物設(shè)計(jì)的數(shù)據(jù),。
目前該研究團(tuán)隊(duì)由 15名研究人員組合,,利用歐洲最具威力的超級(jí)計(jì)算機(jī) MareNostrum,,進(jìn)行蛋白質(zhì)體動(dòng)力學(xué)活動(dòng)的運(yùn)算,在過(guò)去一年中,,使用具有 200個(gè)中央處理器的分析中樞,,進(jìn)行了近50 萬(wàn)小時(shí)的平行分析,據(jù)參與的工作人員表示,,這些動(dòng)力學(xué)的運(yùn)算工作,,如果要利用最好的個(gè)人計(jì)算機(jī)進(jìn)行分析,那可得花上至少 57年的工作時(shí)間,,而目前高效能的工作成果,,就是為了架構(gòu)復(fù)合質(zhì)的動(dòng)力學(xué)圖譜。