來自加拿大多倫多大學(xué)分子及醫(yī)學(xué)遺傳學(xué),、加拿大Health Network大學(xué)(University Health Network),、美國耶魯大學(xué)的研究人員公布了一張包含104種人類miRNAs的1597個高可信度的靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò),并證明miRNAs與mRNA的配對表達(dá)譜(paired expression profiles)可以高精度的識別分辯出功能性miRNA靶向關(guān)系,。這對于研究生物體中miRNAs的作用功能具有重要的意義,。這一研究成果公布在《自然—方法學(xué)》(Nature Methods)雜志上。
微小RNA(microRNA,,簡稱miRNA)是生物體內(nèi)源長度約為20-23個核苷酸的非編碼小RNA,,通過與靶mRNA的互補配對而在轉(zhuǎn)錄后水平上對基因的表達(dá)進(jìn)行負(fù)調(diào)控,導(dǎo)致mRNA的降解或翻譯抑制,。對于miRNAs的研究起始于時序調(diào)控小RNA(stRNAs),,由于miRNAs在物種進(jìn)化中相當(dāng)保守,在植物,、動物和真菌中發(fā)現(xiàn)的miRNAs只在特定的組織和發(fā)育階段表達(dá),,而且這種特異性和時序性,決定了組織和細(xì)胞的功能特異性,,表明miRNA在細(xì)胞生長和發(fā)育過程的調(diào)節(jié)過程中起多種作用,,因此miRNA的研究受到了生物學(xué)家的廣泛關(guān)注。
但是經(jīng)過了前期的研究,,有關(guān)哺乳動物體內(nèi)特異性miRNAs靶標(biāo)的可靠預(yù)測依然存在問題,,而這對于了解生物體中miRNAs的作用及作用途徑而言意義重大。
在這篇文章中,,研究人員證明利用miRNAs與mRNA的配對表達(dá)譜(paired expression profiles)可以高精度的識別分辯出功能性miRNA靶向關(guān)系,。在2006年紐約大學(xué)和加州大學(xué)伯克利分校的研究人員通過計算機分析預(yù)測出了線蟲整個基因組范圍的microRNA靶標(biāo)圖譜,目前已可以從PicTar的網(wǎng)站上獲得線蟲,、人類和果蠅的數(shù)千個基因組范圍的miRNA靶標(biāo)預(yù)測結(jié)果,,這有助于對不同功能的基因組數(shù)據(jù)資源進(jìn)行miRNA靶標(biāo)預(yù)測。