來自加州大學(xué)舊金山分校心血管疾病研究所,，人類遺傳學(xué)研究所等處的研究人員解決了單體型實(shí)驗(yàn)研究的一個(gè)難題：他們發(fā)現(xiàn)了一種能直接在單個(gè)人類DNA分子上同時(shí)觀測(cè)多個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)（multiple polymorphic sites）的分子單體型分析方法。這一研究成果公布在2月8日的《自然—方法學(xué)》（Nature Methods）上,。
單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism,，SNP）,，主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種,。占所有已知多態(tài)性的90%以上,。SNP在人類基因組中廣泛存在，平均每500～1000個(gè)堿基對(duì)中就有1個(gè),，估計(jì)其總數(shù)可達(dá)300萬個(gè)甚至更多,。
由于SNP具有數(shù)量多，分布廣泛,，適于快速,、規(guī)模化篩查,，易于基因分型等方面的特點(diǎn),，因此很適合于對(duì)復(fù)雜性狀與疾病的遺傳解剖以及基于群體的基因識(shí)別等方面的研究,。但是在實(shí)際操作過程中，要想獲得長(zhǎng)基因組片段中的單體型是一件不容易的事,。
在這篇文章中,，研究人員通過對(duì)長(zhǎng)PCR片段進(jìn)行SNP染色標(biāo)記，然后利用全內(nèi)反射顯微鏡（total internal reflection microscopy）就可以閱讀單個(gè)片段的單體型,。
并且研究人員通過精確確定50kb基因組區(qū)域里包含16個(gè)SNP以上的單體型證明了這一方法的有效性,，這種能直接在單個(gè)人類DNA分子上同時(shí)觀測(cè)多個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的分子單體型分析方法為未來SNP以及單體型作圖提供了一種新工具。（生物谷Bioon.com）
生物谷推薦原始出處：
Nature Methods,，doi:10.1038/nmeth.1301,，Ming Xiao，Pui-Yan Kwok
Direct determination of haplotypes from single DNA molecules
Ming Xiao1,5, Eunice Wan1, Catherine Chu1, Wen-Chi Hsueh2,3, Yang Cao1 & Pui-Yan Kwok1,3,4
Determining the long-range haplotypes in a diploid individual is a major technical challenge. Here we report a method of molecular haplotyping by directly imaging multiple polymorphic sites on individual human DNA molecules simultaneously. We demonstrate the utility of this technology by accurately determining the haplotypes consisting of up to 16 single-nucleotide polymorphisms in genomic regions up to 50 kilobases.
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