眾所周知,,人類細(xì)胞可產(chǎn)生成千上萬個不同的microRNA(miRNAs),,其中miRNAs是些小片段遺傳物質(zhì),,有助于確定特定時間打開或關(guān)閉哪一個基因。miRNAs是正常細(xì)胞功能的一個重要部分,,但能促發(fā)人類疾病,,如:特定腫瘤內(nèi)的一些miRNAs被升高,,則會促進(jìn)細(xì)胞存活。為了更好地了解miRNAs如何影響健康與疾病,,研究人員首先必須知道哪一個miRNAs作用于哪一個基因,,考慮到miRNAs絕對數(shù)量與單個miRNA調(diào)控成百上千個基因的事實(shí),這是一個很大的挑戰(zhàn)?,F(xiàn)在,,有一種名為miR-TRAP的新方法問世,它使用方便,,可直接鑒定細(xì)胞內(nèi)miRNA靶標(biāo),。
與現(xiàn)有鑒定miRNA靶標(biāo)的方法相比,miR-TRAP更簡單,、更精確,,主要理由有3個,分別是:首先,,miR-TRAP可直接鑒定正?;蚣膊∏闆r下活體細(xì)胞內(nèi)的miRNA靶標(biāo);其次,,不僅能識別出被miRNAs減少的mRNA靶標(biāo),,也能識別翻譯被抑制的蛋白質(zhì)靶標(biāo),這一靶標(biāo)通常不能被其他技術(shù)檢測出來,,如熒光定量PCR或芯片分析,;第三,不依賴于抗體,,因?yàn)榭贵w能導(dǎo)致非特異性背景信號和復(fù)雜數(shù)據(jù)解釋,。通過對2個重要miRNAs的13個預(yù)測靶標(biāo)的分析,這項(xiàng)技術(shù)不但確認(rèn)了已知的基因靶標(biāo),,還揭示了2個新靶標(biāo),。(生物谷bioon.com)
doi:10.1002/anie.201201512
PMC:
PMID:
miR-TRAP: A Benchtop Chemical Biology Strategy to Identify microRNA Targets
Huricha Baigude, Ahsanullah, Zhonghan Li, Ying Zhou, Tariq M. Rana
It′s a TRAP! microRNAs (miRNAs) are noncoding small RNAs that consist of approximately 21 nucleotides and are assembled into an RNA-induced silencing complex (RISC), which suppresses target mRNA expression. An easy-to-use method called miRNA target RNA affinity purification (miR-TRAP) directly identifies miRNA targets in vivo. This method could be widely used to discover miRNA targets in various disease models under physiological conditions.