眾所周知,,人類細胞可產生成千上萬個不同的microRNA(miRNAs),其中miRNAs是些小片段遺傳物質,,有助于確定特定時間打開或關閉哪一個基因,。miRNAs是正常細胞功能的一個重要部分,但能促發(fā)人類疾病,,如:特定腫瘤內的一些miRNAs被升高,,則會促進細胞存活。為了更好地了解miRNAs如何影響健康與疾病,,研究人員首先必須知道哪一個miRNAs作用于哪一個基因,,考慮到miRNAs絕對數(shù)量與單個miRNA調控成百上千個基因的事實,,這是一個很大的挑戰(zhàn)?,F(xiàn)在,有一種名為miR-TRAP的新方法問世,,它使用方便,,可直接鑒定細胞內miRNA靶標。
與現(xiàn)有鑒定miRNA靶標的方法相比,,miR-TRAP更簡單,、更精確,主要理由有3個,,分別是:首先,,miR-TRAP可直接鑒定正常或疾病情況下活體細胞內的miRNA靶標,;其次,,不僅能識別出被miRNAs減少的mRNA靶標,也能識別翻譯被抑制的蛋白質靶標,,這一靶標通常不能被其他技術檢測出來,,如熒光定量PCR或芯片分析;第三,,不依賴于抗體,,因為抗體能導致非特異性背景信號和復雜數(shù)據(jù)解釋。通過對2個重要miRNAs的13個預測靶標的分析,,這項技術不但確認了已知的基因靶標,,還揭示了2個新靶標。(生物谷bioon.com)
doi:10.1002/anie.201201512
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PMID:
miR-TRAP: A Benchtop Chemical Biology Strategy to Identify microRNA Targets
Huricha Baigude, Ahsanullah, Zhonghan Li, Ying Zhou, Tariq M. Rana
It′s a TRAP! microRNAs (miRNAs) are noncoding small RNAs that consist of approximately 21 nucleotides and are assembled into an RNA-induced silencing complex (RISC), which suppresses target mRNA expression. An easy-to-use method called miRNA target RNA affinity purification (miR-TRAP) directly identifies miRNA targets in vivo. This method could be widely used to discover miRNA targets in various disease models under physiological conditions.