最近嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)的流行提升了全球?qū)W者們尋找新的人類和動物冠狀病毒的興趣,。有全基因組的冠狀病毒種數(shù)不斷增加,自2003年的9種增至2011年的30種左右,;我們實(shí)驗(yàn)室對其中9種冠狀病毒進(jìn)行了測序,包括人冠狀病毒HKU1(β冠狀病毒亞群A),,SARS相關(guān)菊頭蝠屬蝙蝠冠狀病毒(β冠狀病毒亞群B),,菊頭蝠屬蝙蝠冠狀病毒HKU2(α冠狀病毒),β冠狀病毒2個(gè)新亞群(C和D)的3種蝙蝠冠狀病毒和3種禽冠狀病毒[它們構(gòu)成所提出的新屬(δ冠狀病毒)]。
為了迅速和精確地成批測序檢索(這是比較基因和基因組分析的基礎(chǔ)和瓶頸),,最近我們還開發(fā)了注解冠狀病毒基因和基因組的綜合數(shù)據(jù)庫,,CoVDB(http://covdb.microbiology.hku.hk)。隨著可獲得的基因組數(shù)量和方便用戶的數(shù)據(jù)庫數(shù)量的增加,,可以產(chǎn)生用于高效下游分析的便于比較基因組的分析和更具體的爆炸性搜索結(jié)果,。
注:該報(bào)告曾收集于《第五屆地壇國際感染病會議論文摘要》(生物谷 Bioon.com)