863計劃生物信息技術(shù)主題2004年度在生物信息的獲取與開發(fā),、加工與利用方面取得了較大的進展：
生物信息技術(shù)研究中心初具規(guī)模
初步建立了以上海,、北京為基地的分布式國家級生物信息技術(shù)研究中心,，為全國近100家科研單位提供了技術(shù)服務,，在國家生命科學,、生物技術(shù)和相關(guān)交叉研究領(lǐng)域研究中發(fā)揮了重要作用,。本年度以國家級生物信息技術(shù)中心為主體發(fā)表了包括Science,，Nature Biotechnology, Bioinformatics等高水平的研究論文,，這些具有國際影響的原始論文都有相應的自有數(shù)據(jù)庫和分析軟件系統(tǒng),，其研究成果得到國際認可表明我國分布式生物信息研究中心已經(jīng)初具規(guī)模。
自主構(gòu)建和完善了20多個數(shù)據(jù)庫,，數(shù)據(jù)規(guī)模超過2TB
生物信息技術(shù)數(shù)據(jù)庫建設取得了重要進展,，構(gòu)建和完善包括核酸、蛋白序列,、信號轉(zhuǎn)導,、生化代謝通路、結(jié)構(gòu)和功能域信息,、表皮葡萄球菌,、鉤端螺旋體等自主研發(fā)的數(shù)據(jù)庫。這些規(guī)范化的自有數(shù)據(jù)庫的建立,，大大改變了我國過去在生命科學數(shù)據(jù)庫建設方面沒有標準和規(guī)范,，零散和安全性差的落后局面。同時還整合了150多個國際生命科學研究公共數(shù)據(jù)庫,，達到國際生命科學研究公共數(shù)據(jù)庫的2/3,。
參與制定蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)標準，被國際人類蛋白質(zhì)組學研究組織采納并使用
與歐盟有關(guān)研究機構(gòu)EBI共同制定的蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)標準已被國際人類蛋白質(zhì)組學研究組織（HUPO）采納并使用,，按照此標準構(gòu)建了我國第一個,、也是國際上第一個蛋白質(zhì)表達譜數(shù)據(jù)庫,，已提供給我國主導的“人類肝臟蛋白質(zhì)組研究計劃（HLPP）”使用,。同時，參與國際單核苷酸多態(tài)性（SNP）數(shù)據(jù)交換標準制定工作,，自主構(gòu)建的SNP數(shù)據(jù)庫已經(jīng)上網(wǎng)提供服務,。
數(shù)字化虛擬人研究取得良好進展
初步建立數(shù)字化虛擬人體模型，人體數(shù)字信息關(guān)鍵技術(shù)獲得重要進展,，已獲得具有自主知識產(chǎn)權(quán)的男女成人切片數(shù)據(jù)集,，以及包括顱腦、心臟,、腎臟和肝臟在內(nèi)的十二套原始數(shù)據(jù)集及其按不同用途開發(fā)的子數(shù)據(jù)集,，解決了人體局部器官的海量數(shù)據(jù)管理和共享難題,，實現(xiàn)了基于計算機并行處理的局部器官的三維重建和可視化。
Bio-science可視化生物信息數(shù)據(jù)分析軟件系統(tǒng)成功開發(fā)并進入市場銷售
上海生物信息技術(shù)研究中心開發(fā)出我國第一個市場化的大型生物信息學數(shù)據(jù)分析產(chǎn)品——Bio-Science可視化生物信息數(shù)據(jù)分析軟件系統(tǒng),，市場售價高達27.5萬歐元一套,，歐洲著名制藥公司Aventis已經(jīng)購買了該軟件系統(tǒng)。同時,，在這一大型軟件包的基礎(chǔ)上,，國際500強制藥公司日本的Japan Tobacco已經(jīng)表示愿與中方進一步共同開發(fā)面向藥物研發(fā)的蛋白質(zhì)組功能注釋的生物信息學工作流軟件。
開發(fā)了一批有自主知識產(chǎn)權(quán)的軟件并投入了應用
2004年在主題支持下研制的大量軟件提供給國內(nèi)外科研機構(gòu)使用,，這些軟件涵蓋大規(guī)?；蚪M測序數(shù)據(jù)拼接、基因組功能注釋,、基因表達序列標簽數(shù)據(jù)分析,、生物芯片數(shù)據(jù)分析、藥物毒理分析,、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能預測分析,、藥物分子設計等眾多方面。其中多肽指紋圖譜鑒定軟件包的開發(fā),，打破了國外產(chǎn)品在中國的壟斷地位（同類產(chǎn)品單個CPU國際市場銷售價$1600,，而大規(guī)模的蛋白鑒定需要的計算機集群其CPU個數(shù)至少超過16個），該項產(chǎn)品將進行商業(yè)開發(fā)和市場推廣,。北京大學自主開發(fā)的藥物設計和蛋白質(zhì)工程設計軟件包被國內(nèi)外約900家研究所,、公司使用，一些國外公司已經(jīng)表示了強烈的對此軟件包進行商業(yè)開發(fā)的意向,。
