由中國科學(xué)院上海藥物研究所完成的發(fā)明“組合化學(xué)集中庫設(shè)計(jì)與優(yōu)化方法”目前獲得國家發(fā)明專利授權(quán)(專利號ZL200410053102.6)。

    該項(xiàng)發(fā)明涉及一種組合化學(xué)集中庫設(shè)計(jì)與優(yōu)化方法,，是對一種虛擬組合化學(xué)集中庫軟件包的設(shè)計(jì),、建立與評價(jià)優(yōu)化的方法、包括第一步以靶標(biāo)為基礎(chǔ)設(shè)計(jì)虛擬組合初步篩選庫,；第二步建立虛擬組合初步篩選庫并對分子構(gòu)象進(jìn)行優(yōu)化,；第三步對虛擬組合初步篩選庫進(jìn)行評價(jià)及其優(yōu)化。該項(xiàng)發(fā)明采用遺傳算法與組合化學(xué)方法相結(jié)合,，可以用于基于大分子靶標(biāo)三維結(jié)構(gòu)的全新藥物的設(shè)計(jì)和研究,。對靶標(biāo)具有比較高的親和性、多樣性和類藥性,。具有速度快,、費(fèi)用低、不耗費(fèi)任何實(shí)驗(yàn)器材,，完全通過計(jì)算模擬的方法來完成組合化學(xué)集中庫的設(shè)計(jì)和優(yōu)化,。

    藥物發(fā)現(xiàn)是一個綜合了多學(xué)科的，復(fù)雜的研究和探索過程,，其主要步驟可以簡要概括為從基因到蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)到先導(dǎo)化合物,，再對先導(dǎo)化合物進(jìn)行評估和優(yōu)化這樣一個循環(huán)反復(fù),、螺旋式上升的過程。在這個過程中,，計(jì)算機(jī)早已成為不可缺少的手段，分子模擬,、組合化學(xué),、構(gòu)效關(guān)系以及數(shù)據(jù)挖掘等領(lǐng)域都是計(jì)算機(jī)大顯身手的地方。利用計(jì)算機(jī)采用各種可能的方法,，搜尋和優(yōu)化先導(dǎo)化合物,，提高其理化指標(biāo)和生物活性，已成為藥物發(fā)現(xiàn)過程中的關(guān)鍵步驟之一,。隨著人類基因組測序工作的基本完成,，為藥物研究提供了大量的新分子靶標(biāo)，因而基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)與組合化學(xué)相結(jié)合的計(jì)算機(jī)模擬篩選方法已經(jīng)成為一個有效的發(fā)現(xiàn)藥物的途徑,。