2009年發(fā)布的國家基本藥物目錄包括基層醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)配備使用和其他醫(yī)療機(jī)構(gòu)配備使用兩個部分,。目前,，已先期公布的《國家基本藥物目錄（基層醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)配備使用部分）》（2009版）,，包括化藥、中成藥共有307個品種,。
SFDA南方醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)研究所廣州標(biāo)點(diǎn)醫(yī)藥信息有限公司的中國藥品醫(yī)院市場用藥分析系統(tǒng)（HDM系統(tǒng)）和中國藥品零售市場用藥分析系統(tǒng)（RDM系統(tǒng)）這兩大終端用析系統(tǒng),，對新舊基本藥物目錄藥品的用藥數(shù)據(jù)進(jìn)行了對比分析與研究。
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