關(guān)鍵詞: FDA 加州大學(xué) 安捷倫 CDC 10萬(wàn)基因組計(jì)劃 致病菌基因組 數(shù)據(jù)庫(kù)
日前,,美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)、加利福尼亞州大學(xué)戴維斯分校,、安捷倫科技公司、美國(guó)疾病控制與預(yù)防中心(CDC)宣布啟動(dòng)“10萬(wàn)基因組計(jì)劃”,,該項(xiàng)目歷時(shí)五年,,旨在合作創(chuàng)建一個(gè)包含10萬(wàn)種食源性致病菌基因組的公共數(shù)據(jù)庫(kù),以加速食源性疾病暴發(fā)的細(xì)菌鑒定,。
該計(jì)劃將對(duì)約10 萬(wàn)種重要的食源性致病菌(包括沙門(mén)氏菌,、李斯特菌和大腸桿菌等重要的致病菌)測(cè)序,并將測(cè)序信息序儲(chǔ)存在美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院下屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)的公共數(shù)據(jù)庫(kù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)將開(kāi)放訪問(wèn),,提供能鑒定病原體及其來(lái)源的檢測(cè)方法,。一旦暴發(fā)食源性疾病,該類檢測(cè)有可能在幾天甚至是幾小時(shí)內(nèi)展開(kāi)公共衛(wèi)生應(yīng)對(duì),,而不是傳統(tǒng)的幾周內(nèi),,從而顯著減少公共衛(wèi)生應(yīng)對(duì)時(shí)間。
在該項(xiàng)目中,,測(cè)序工作將由加州大學(xué)戴維斯分校協(xié)調(diào)完成,,具體由新成立的華大基因-加州大學(xué)戴維斯分校聯(lián)合基因組中心完成,,該校同時(shí)還開(kāi)放其收集的細(xì)菌樣本庫(kù),;FDA 提供500 多份已完成的沙門(mén)氏菌全基因組序列草圖,提供數(shù)千份其他種重要的食源性病原體供測(cè)序,,并提供生物信息學(xué)支持,,其科學(xué)家們也將在需要時(shí)指導(dǎo)該項(xiàng)目并提供技術(shù)支援;安捷倫提供專業(yè)知識(shí),、設(shè)備,、儀器和資金支持加州大學(xué)戴維斯分校測(cè)序;CDC 將提供食源性疾病的專業(yè)知識(shí),,提供菌株供測(cè)序,,并提供該項(xiàng)目所需要的其他信息,CDC 專家還將參與到項(xiàng)目指導(dǎo)委員會(huì),。(生物谷 Bioon.com)