關鍵詞: FDA 加州大學 安捷倫 CDC 10萬基因組計劃 致病菌基因組 數(shù)據(jù)庫
日前,,美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA),、加利福尼亞州大學戴維斯分校,、安捷倫科技公司、美國疾病控制與預防中心(CDC)宣布啟動“10萬基因組計劃”,,該項目歷時五年,,旨在合作創(chuàng)建一個包含10萬種食源性致病菌基因組的公共數(shù)據(jù)庫,以加速食源性疾病暴發(fā)的細菌鑒定,。
該計劃將對約10 萬種重要的食源性致病菌(包括沙門氏菌,、李斯特菌和大腸桿菌等重要的致病菌)測序,并將測序信息序儲存在美國國立衛(wèi)生研究院下屬的國家生物技術信息中心(NCBI)的公共數(shù)據(jù)庫,。該數(shù)據(jù)庫將開放訪問,,提供能鑒定病原體及其來源的檢測方法。一旦暴發(fā)食源性疾病,,該類檢測有可能在幾天甚至是幾小時內展開公共衛(wèi)生應對,,而不是傳統(tǒng)的幾周內,從而顯著減少公共衛(wèi)生應對時間,。
在該項目中,,測序工作將由加州大學戴維斯分校協(xié)調完成,具體由新成立的華大基因-加州大學戴維斯分校聯(lián)合基因組中心完成,,該校同時還開放其收集的細菌樣本庫,;FDA 提供500 多份已完成的沙門氏菌全基因組序列草圖,提供數(shù)千份其他種重要的食源性病原體供測序,,并提供生物信息學支持,,其科學家們也將在需要時指導該項目并提供技術支援;安捷倫提供專業(yè)知識,、設備,、儀器和資金支持加州大學戴維斯分校測序;CDC 將提供食源性疾病的專業(yè)知識,,提供菌株供測序,,并提供該項目所需要的其他信息,CDC 專家還將參與到項目指導委員會,。(生物谷 Bioon.com)