科學家對于人類誘導多能干細胞（iPSC）與胚胎干細胞（ESC）之間的差異程度，以及兩種類型的細胞系之間的差異一直存在著許多爭論,。日前,，由美國科學家研制的一個基于iPSC系和ESC系的定量及具有功能描述能力的評分系統(tǒng)，為細胞系的評估提供了一種實用方法,。
在這項研究中,，馬薩諸塞州劍橋市哈佛大學的Christoph Bock和同事對20個已經建立的人類ESC系以及12個iPSC系進行了全基因組的DNA甲基化繪圖，以及基于微陣列的基因圖譜表達,。就像預期的那樣,，不同ESC系的遺傳和轉錄狀態(tài)具有很高的相似性，并且研究人員利用ESC數據計算出了一條“參考通路” ,，從而作為對一個多能細胞系中的每個基因的預期基因表達和DNA甲基化水平的一種測量方法,。他們隨后開始考慮iPSC與ESC到底有多類似。研究人員發(fā)現,，許多iPSC系的基因表達和甲基化屬于在ESC系中觀測到的偏差,，但總的來說，兩種細胞系之間的差異多于每種細胞系之中的差異,。
多能細胞系之間的差異具有功能上的意義嗎,？與之前的研究一樣，Bock等人發(fā)現,，在ESC或iPSC中,，基因中的細胞系特定DNA甲基化差異，以及細胞特性的作用，能夠改變細胞的分化潛能,。
為了使之成為一個能夠穩(wěn)定評估新細胞系有效性的系統(tǒng),，研究人員開發(fā)出了一種兩步法。第一步,，通過一種“差異計分卡”——記錄基因的表達和DNA甲基化水平與參考面板進行比較時的異常值——對一個細胞系進行評估,。第二步，對細胞系進行一種非定向的分化試驗,，并且細胞分化成多種細胞系的傾向也被加以計算,。這些結果被用來與一個“世系計分卡”——已通過20種對照ESC系進行了校準——進行了比較。研究人員指出,，這一評分系統(tǒng)提供了細胞系質量和效用的信息,，并且適合擴展到對大量細胞系的篩選工作。研究人員在最近出版的《細胞》雜志上報告了這一研究成果,。
研究人員表示,，這項研究代表了用系統(tǒng)方法進行干細胞評估的一個進步，并且能夠被用來評估產生iPSC的新方法,，或者旨在下游應用的細胞的適合性
