研究人員發(fā)明了一種新方法,，可測(cè)出人類腫瘤組織中蛋白質(zhì)的數(shù)量，新成果發(fā)表在4月在線出版的《自然—方法學(xué)》（Nature Methods）期刊上,。
蛋白質(zhì)組學(xué)是大規(guī)模研究細(xì)胞蛋白質(zhì)的方法,，主要使用質(zhì)譜技術(shù)。通過(guò)質(zhì)譜技術(shù),，科學(xué)家們已經(jīng)研制出許多測(cè)量生物樣品中蛋白質(zhì)數(shù)量的方法,，其中一種方法名為細(xì)胞培養(yǎng)氨基酸穩(wěn)定同位素標(biāo)記SILAC。使用SILAC,，生物樣品中的蛋白質(zhì)被含有“重同位素”的氨基酸所標(biāo)記，這種被標(biāo)記的蛋白質(zhì)在質(zhì)譜儀中被去除,，因此可與未標(biāo)記的樣品進(jìn)行比較,。這種方法需要非常精確的量化分析。然而,，這種方法只適用于能夠完全被重氨基酸所代謝標(biāo)記的組織或細(xì)胞,。
Matthias Mann和同事對(duì)SILAC方法進(jìn)行了改進(jìn)，能夠測(cè)出人類原發(fā)性腫瘤中的蛋白質(zhì)數(shù)量,，而這種腫瘤本身不能被代謝標(biāo)識(shí),。包括腫瘤在內(nèi)的人類組織是由許多種類的細(xì)胞組成，它們能在不同水平上表達(dá)蛋白質(zhì),。為了代表取自特定腫瘤中的許多不同類型的細(xì)胞和蛋白質(zhì),，研究小組用重氨基酸標(biāo)識(shí)了含有不同永生人類癌癥細(xì)胞系的混合物。采用這種超級(jí)SILAC方法,，他們精確測(cè)出人類腫瘤組織中的蛋白質(zhì)數(shù)量,，包括乳腺癌和腦癌組織。
除了可用于腫瘤生物學(xué)以外,，超級(jí)SILAC方法還可應(yīng)用于蛋白質(zhì)生物標(biāo)識(shí)的發(fā)現(xiàn),，以檢測(cè)早期癌癥,。（生物谷Bioon.com）
生物谷推薦原文出處：
Nature Methods doi:10.1038/nmeth.1446
Super-SILAC mix for quantitative proteomics of human tumor tissue
Tamar Geiger , Juergen Cox , Pawel Ostasiewicz , Jacek R Wisniewski & Matthias Mann
We describe a method to accurately quantify human tumor proteomes by combining a mixture of five stable-isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC)-labeled cell lines with human carcinoma tissue. This generated hundreds of thousands of isotopically labeled peptides in appropriate amounts to serve as internal standards for mass spectrometry–based analysis.
