為了更好地理解惡性腫瘤（肉瘤,，sarcomas）的信號通路,，近日，來自莫非特癌癥研究中心的研究者使用先進(jìn)的基于蛋白質(zhì)組學(xué)的質(zhì)譜分析法對一組蛋白質(zhì)酶的特性進(jìn)行分析,，這組酶在癌癥生物學(xué)中扮演者重要的開關(guān)作用,。研究者發(fā)現(xiàn)一種酪氨酸激酶可以驅(qū)動（driver）惡性腫瘤的生長和生存。相關(guān)研究成果刊登在了近日的國際雜志Cancer Research上,。
一般的癌癥（carcinomas）來源于上皮細(xì)胞,，如乳腺癌，肺癌等,；然而,，肉瘤（sarcomas）卻是一種罕見的癌癥,，這種肉瘤癌來源于骨頭、脂肪,、肌肉或者血管組織,。研究者Eric B.Haura介紹說，肉瘤是一種罕見多樣的惡性腫瘤,，由結(jié)締組織產(chǎn)生,，目前我們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一種可以介導(dǎo)這種癌癥細(xì)胞生長和存在的重要蛋白質(zhì)。
研究者Haura和其研究團(tuán)隊重點研究癌癥的信號通路,，他們對一組激酶進(jìn)行研究,，蛋白質(zhì)的磷酸化作用在一些癌癥細(xì)胞中扮演著重要的作用。研究者使用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),，來對其進(jìn)行研究,。研究者M(jìn)offitt表示，他們在肉瘤細(xì)胞中識別到了1936個特殊的酪氨酸磷酸化肽,、844個特殊的磷酸化酪氨酸蛋白和39個酪氨酸激酶,。目前在人類基因組中存在99種酪氨酸激酶，研究者識別出的多肽類中有將近40%的酪氨酸蛋白激酶組成員,。
酪氨酸激酶在控制癌癥的標(biāo)志物上扮演著重要的作用，而且對于用藥物控制法治療癌癥也有明顯作用,。研究者的目標(biāo)就是生產(chǎn)出一組酪氨酸磷酸化蛋白質(zhì)和優(yōu)化的酪氨酸激酶用于后續(xù)的功能驗證,，Haura表示，我們識別出了大量的酪氨酸激酶,，這些酪氨酸激酶對于人類肉瘤細(xì)胞中的信號通路非常重要,，可以促進(jìn)肉瘤細(xì)胞生長繁殖。因此,，這些酪氨酸激酶將成為一種藥物靶點,，我們可以使用小分子的抑制劑來作用此靶點，最終影響肉瘤細(xì)胞的生長,。
當(dāng)然,，問題依舊存在，研究者發(fā)現(xiàn)的將近10個酪氨酸激酶都能調(diào)節(jié)肉瘤的生長和生存嗎,？
這將幫助研究者優(yōu)化潛在的藥物靶點,，包括改進(jìn)嚴(yán)重肉瘤病人的相關(guān)臨床試驗。首先,，研究者用一些選出的抑制劑對肉瘤細(xì)胞作用進(jìn)行篩選,，并且識別出一些潛在有用的藥物。研究者在肉瘤中發(fā)現(xiàn)的激酶可以應(yīng)用于后續(xù)的研究,，而且研究者希望繼續(xù)進(jìn)行深入的研究以給臨床試驗和治療提供更多的建議和線索,。（生物谷：T.Shen編譯）
doi:10.1158/0008-5472.CAN-11-3015
PMC:
PMID:
Phosphoproteomics Identifies Driver Tyrosine Kinases in Sarcoma Cell Lines and Tumors
Yun Bai1, Jiannong Li1, Bin Fang5, Arthur Edwards1, Guolin Zhang1, Marilyn Bui2, Steven Eschrich4, Soner Altiok2, John Koomen3,5, and Eric B. Haura1
Driver tyrosine kinase mutations are rare in sarcomas, and patterns of tyrosine phosphorylation are poorly understood. To better understand the signaling pathways active in sarcoma, we examined global tyrosine phosphorylation in sarcoma cell lines and human tumor samples. Anti-phosphotyrosine antibodies were used to purify tyrosine phosphorylated peptides, which were then identified by liquid chromatography and tandem mass spectrometry. The findings were validated with RNA interference, rescue, and small-molecule tyrosine kinase inhibitors. We identified 1,936 unique tyrosine phosphorylated peptides, corresponding to 844 unique phosphotyrosine proteins. In sarcoma cells alone, peptides corresponding to 39 tyrosine kinases were found. Four of 10 cell lines showed dependence on tyrosine kinases for growth and/or survival, including platelet-derived growth factor receptor (PDGFR)α, MET, insulin receptor/insulin-like growth factor receptor signaling, and SRC family kinase signaling. Rhabdomyosarcoma samples showed overexpression of PDGFRα in 13% of examined cases, and sarcomas showed abundant tyrosine phosphorylation and expression of a number of tyrosine phosphorylated tyrosine kinases, including DDR2, EphB4, TYR2, AXL, SRC, LYN, and FAK. Together, our findings suggest that integrating global phosphoproteomics with functional analyses with kinase inhibitors can identify drivers of sarcoma growth and survival. Cancer Res; 72(10); 2501–11. ©2012 AACR.
