癌癥是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌癥死亡的人口超過720萬人,。而在中國,，每年因癌癥死亡的人口也超過了170萬。因此,，開發(fā)新的抗癌藥物是科學(xué)界和醫(yī)學(xué)界的熱點和難點,。但直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點,。以小分子為例,，現(xiàn)在已知的小分子化合物超過了1000萬個，因此直接采用實驗的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的,。因此建立一個高效,、可靠、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計算生物學(xué)篩選系統(tǒng)對發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義,。
為了建立抗癌藥物活性的計算生物學(xué)預(yù)測系統(tǒng),，在中國科學(xué)院昆明動物研究所生物信息與系統(tǒng)生物學(xué)實驗室黃京飛研究員的指導(dǎo)下， 李功華博士開發(fā)了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法,，并將該算法應(yīng)用于預(yù)測小分子的抗癌活性。通過交叉驗證,，其得到的結(jié)果令人振奮：其預(yù)測的線下面積（AUC）達到了0.878,，顯示該算法能很好的預(yù)測藥物小分子的抗癌活性。為了使該算法能被不同學(xué)科的研究者和醫(yī)藥工作者應(yīng)用,，李功華博士開發(fā)了一個簡便易用的預(yù)測抗癌藥物活性的網(wǎng)頁服務(wù)器（http://bsb.kiz.ac.cn/CDRUG/)
該研究目前發(fā)表在最新一期的頂級計算生物學(xué)雜志《Bioinformatics》上（生物谷Bioon.com）
doi: 10.1093/bioinformatics
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CDRUG: a web server for predicting anticancer activity of chemical compounds
Li GH, Huang JF.
Cancer is the leading cause of death worldwide. Screening anticancer candidates from tens of millions of chemical compounds is expensive and time-consuming. A rapid and user-friendly web server, known as CDRUG, is described here to predict the anticancer activity of chemical compounds. In CDRUG, a hybrid score was developed to measure the similarity of different compounds. The performance analysis shows that CDRUG has the area under curve of 0.878, indicating that CDRUG is effective to distinguish active and inactive compounds.
