癌癥是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌癥死亡的人口超過(guò)720萬(wàn)人,。而在中國(guó)，每年因癌癥死亡的人口也超過(guò)了170萬(wàn),。因此,，開發(fā)新的抗癌藥物是科學(xué)界和醫(yī)學(xué)界的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。但直接采用實(shí)驗(yàn)的方法篩選抗癌藥物具有花費(fèi)大,、時(shí)間長(zhǎng)的特點(diǎn),。以小分子為例，現(xiàn)在已知的小分子化合物超過(guò)了1000萬(wàn)個(gè),，因此直接采用實(shí)驗(yàn)的方法從這1000萬(wàn)個(gè)化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的,。因此建立一個(gè)高效、可靠,、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計(jì)算生物學(xué)篩選系統(tǒng)對(duì)發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義,。
為了建立抗癌藥物活性的計(jì)算生物學(xué)預(yù)測(cè)系統(tǒng)，在中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所生物信息與系統(tǒng)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室黃京飛研究員的指導(dǎo)下,， 李功華博士開發(fā)了一個(gè)新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對(duì)算法,，并將該算法應(yīng)用于預(yù)測(cè)小分子的抗癌活性。通過(guò)交叉驗(yàn)證,，其得到的結(jié)果令人振奮：其預(yù)測(cè)的線下面積（AUC）達(dá)到了0.878,，顯示該算法能很好的預(yù)測(cè)藥物小分子的抗癌活性。為了使該算法能被不同學(xué)科的研究者和醫(yī)藥工作者應(yīng)用,，李功華博士開發(fā)了一個(gè)簡(jiǎn)便易用的預(yù)測(cè)抗癌藥物活性的網(wǎng)頁(yè)服務(wù)器（http://bsb.kiz.ac.cn/CDRUG/)
該研究目前發(fā)表在最新一期的頂級(jí)計(jì)算生物學(xué)雜志《Bioinformatics》上（生物谷Bioon.com）
doi: 10.1093/bioinformatics
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CDRUG: a web server for predicting anticancer activity of chemical compounds
Li GH, Huang JF.
Cancer is the leading cause of death worldwide. Screening anticancer candidates from tens of millions of chemical compounds is expensive and time-consuming. A rapid and user-friendly web server, known as CDRUG, is described here to predict the anticancer activity of chemical compounds. In CDRUG, a hybrid score was developed to measure the similarity of different compounds. The performance analysis shows that CDRUG has the area under curve of 0.878, indicating that CDRUG is effective to distinguish active and inactive compounds.
