生物谷報(bào)道:隨著人類基因組測(cè)序工作的完成,,遺傳學(xué)家已經(jīng)急不可待地開始對(duì)其他有機(jī)體進(jìn)行測(cè)序,其部分原因是想知道種間哪些DNA區(qū)域具有相似性并且因此可能具有重要的功能,。但是,,這些研究又引發(fā)了一個(gè)重要的問題:需要完成多少個(gè)物種的測(cè)序才能知道是否進(jìn)化過(guò)程保留下來(lái)了一個(gè)特定的DNA片斷。在發(fā)表在2005年1月的PLoS Biology上的一篇文章中,,霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所的Sean R. Eddy給出了一個(gè)能夠詳細(xì)解答這個(gè)問題的數(shù)學(xué)模型,。
根據(jù)Eddy的模型,問題的關(guān)鍵是確定應(yīng)該測(cè)序哪些物種,。對(duì)多個(gè)物種進(jìn)行比較以確定被保存下來(lái)的DNA基礎(chǔ),。還有,有機(jī)體在進(jìn)化過(guò)程中的親緣關(guān)系越近,,則越需要進(jìn)行比較從而得知一個(gè)給定的DNA區(qū)域是否在種間得以保留,。
這個(gè)模型發(fā)現(xiàn)檢測(cè)變異的單個(gè)核苷酸將需要比較大約17個(gè)平均進(jìn)化分隔距離像人和老鼠一樣的基因組。但是,,當(dāng)被保留的核苷發(fā)生變化則需要測(cè)定25個(gè)基因組,。
這個(gè)模型能夠成功模擬真實(shí)核苷酸的進(jìn)化模式。它還能精確預(yù)測(cè)現(xiàn)有基因組比較的結(jié)果,。這項(xiàng)研究將有助于指導(dǎo)人們思考如何利用比較性資料以及到底需要多少資料(http://www.bioon.com/),。