美國Eurekalert網4月11日報道,，全球第一個注釋生物模型數據庫--BioModels http://www.ebi.ac.uk/biomodels/ 正式啟動。BioModels是歐洲生物信息研究所(EBI),、和SBML Team（作為一個國際性小組，開發(fā)針對生物體系描述的開放源標準）共同合作的結晶,。同時還得到了美國Keck研究所,、日本系統(tǒng)生物學研究所和南非斯坦陵布什大學（Stellenbosch University）的大力支持。
即使最簡單的生物體也執(zhí)行著一系列不同的程序,，以復雜的方式互相連接確保生物體對環(huán)境變化做出適時反應,。人類深入了解這些程序的最佳方法是建立計算機模型。如果某種計算機模型與真正的生物體表現不同的話,，就表明我們忽略了該體系的一個重要構成,。定量模型還能揭示出復雜體系中曾被忽略的部分，為新的藥物治療鋪平道路,。這種被稱為“計算機系統(tǒng)生物學” （computational systems biology）的方法正日益流行,，科學家也正積累各種生物的詳細目錄表。
EBI的Nicolas解釋說：“目前為止,，計算機模型建立者們沒有固定方法交流生物體系描述，也沒有地方可以放置或共享新模型,。BioModels數據庫的創(chuàng)立就是為了解決這些問題,。”
首先就是要制定用來描述生物模型的標準。由SBML開發(fā)的系統(tǒng)生物學標記語言（The Systems Biology Markup Language）,，作為一種開放源計算機語言,，正在受到廣泛的接受，并得到全世界約75個不同軟件系統(tǒng)的支持,。生物學家可以選擇一種工具來編寫模型,，然后供他人共享。
加利福尼亞技術研究所的Michael Hucka說：“下一步是建立一個團體性資源,，這正是BioModels數據庫的目的所在,。人們可以通過BioModels來對生物化學和分子生物學體系的定量模型進行發(fā)表和評論。這些體系有的很簡單,，只包含一些程序和反應,，而有些則很復雜。模型上的注釋可以讓使用者準確地確定模型的構成,，幫助他們重新得到合適的模型,。
Nicolas說：“我們希望能鼓勵人們發(fā)表新的模型并放在BioModels數據庫中，這將確保所有公共領域的模型能有最大的利用價值,。”
