許多微生物的基因組序列都編碼一些假定的生物合成基因簇,,但是相對(duì)應(yīng)的天然產(chǎn)物卻一直沒(méi)有確定出來(lái)。最新一期的Chemistry & Biology雜志的封面圖片則呈現(xiàn)了一種分離和描述這些“孤兒”基因簇產(chǎn)物的一種全新方法,。
這張圖片的背景是植物根上假單胞菌熒光Pf-5細(xì)胞顯微照片,,DsRed熒光蛋白將植物根可視化。這種假單胞菌熒光Pf-5細(xì)胞還能夠在純培養(yǎng)物中生長(zhǎng),,并且它的完整基因組已經(jīng)知道,。
通過(guò)生物信息學(xué)方法,研究人員推測(cè)出一個(gè)基因組中的“孤兒”基因簇編碼一種lipopeptide產(chǎn)物,,以確定出對(duì)應(yīng)的天然產(chǎn)物的前體,,而該天然產(chǎn)物則被氮15和fed所標(biāo)記,。
順次,這種同位素標(biāo)記能夠利用核磁共振儀觀察到,,進(jìn)而知道分離和最終新lipopeptide的結(jié)構(gòu)確定,。研究人員將這種lipopeptide給了俗名——orfamide A。
這篇文章的作者是美國(guó)加州大學(xué),、俄勒岡大學(xué)等高校的研究人員,,文章的通訊作者是Joyce E. Loper。