23日,，Mitrionics; Software Acceleration Platform 及Mitrion Virtual Processor的發(fā)展商Mitrionics; AB與SGI®在第十五屆分子生物學(xué)智能系統(tǒng)國際會議(ISMB)及第六屆歐洲計(jì)算生物學(xué)會議(ECCB)上展出其最新開源軟件技術(shù)──FPGA加速生物信息程序,。
在2007年7月20至25日奧地利維也納舉行的會議期間,，Mitrionics將在攤位內(nèi)展出Mitrion Development Platform、Mitrion Virtual Processor和最新推出的Mitrion-accelerated NCBI BLAST-n生物信息程序,。
Mitrion Accelerated NCBI BLAST結(jié)合了三大卓越組合,，包括：Xilinx省電強(qiáng)力的FPGAs、SGI® Altix®服務(wù)器的超快內(nèi)存副系統(tǒng)及Mitrion Virtual Processor，其運(yùn)作速度遠(yuǎn)勝其它產(chǎn)品,。在單一FPGA上持續(xù)運(yùn)作的速度,，比利用2.8GHz 雙核心 AMD Opteron 處理器的8220 SE.(1)單核運(yùn)作快60倍。
之外,，2007年生物信息開源會議(BOSC 2007)上,，Mitrionics的高級軟件工程師Henrik Abelsson介紹到，Mitrion加速BLAST開源程序及Mitrion-C Open Bio Project如何能夠利用開源程序進(jìn)行發(fā)展,，并對生物信息族群做出貢獻(xiàn),。而Henrik Abelsson本人也是Mitrion-accelerated BLAST 程序的主要開發(fā)人員。
Mitrionics AB行政總裁Anders Dellson表示：“Mitrionics的開源加速BLAST程序利用了SGI的RASC系統(tǒng),，并已正式在各處投入服務(wù),。合并方案為業(yè)界就純正的處理性能及超低耗電量訂立了全新基準(zhǔn),，更能為 全球研究所及制藥公司的基因?qū)W研究帶來實(shí)時(shí)好處,。”
SGI科學(xué)發(fā)展經(jīng)理Michael Brown稱，Mitrion加速BLAST-n利用SGI RASC生物信息器材,，能使速度提升60倍以上,。用戶只需更改BLAST-n資源碼的0.2%，便能取得這種效果,。特別對于計(jì)算密度要求更到的程序,，更能體現(xiàn)其有點(diǎn)。
而對于利用Mitrion Virtual Processor 帶來BLAST優(yōu)化,，分析人事認(rèn)為,，能進(jìn)行大規(guī)模平衡處理的Mitrion Virtual Processor (MVP)是Mitrion Platform的核心所在，這也是全新加速M(fèi)itrion-BLAST的重要組成部分,。
MVP及其相關(guān)軟件全部由Mitrion-C編程語言開發(fā),，基于FPGAs語言寫成，所以程序員無需掌握硬件設(shè)計(jì)技巧,，也能輕松使用,。
Mitrion Virtual Processor的結(jié)構(gòu)獨(dú)特，能因應(yīng)運(yùn)作程序而調(diào)教,，發(fā)揮最佳性能,，更可大幅減低發(fā)展FPGA加速軟件的總成本。更重要的是,，本處理器讓整個(gè)超級計(jì)算機(jī)業(yè)界都能受惠于FPGA的程序加速技術(shù),。
SGI | Innovation for Results™簡介
SGI (納斯達(dá)克：SGIC)專門發(fā)展高性能計(jì)算機(jī)，在業(yè)內(nèi)首屈一指,，能提供一系列高性能服務(wù)器及儲存方案,，并其它業(yè)內(nèi)尖端專業(yè)服務(wù)，又能支持客戶應(yīng)付復(fù)雜的密集信息工作流程，加快突破性的發(fā)現(xiàn),、創(chuàng)新及信息更新,。
SGI方案協(xié)助客戶解決計(jì)算機(jī)應(yīng)用帶來的問題，包括：透過藥物研究提升生活水平,、設(shè)計(jì)及生產(chǎn)更安全有效的汽車與飛機(jī),、研究全球氣候、提供國土安全及國防所需科技,，或協(xié)助企業(yè)管理大量信息等,。
Mitrionics 簡介
Mitrionics, Inc.于2001年正式成立，是FPGA超級計(jì)算機(jī)的業(yè)內(nèi)翹楚,。FPGA超級計(jì)算機(jī)為近年新興發(fā)展,，能提升處理器能量，減少能源消耗,，比計(jì)算機(jī)系統(tǒng)群組更勝一籌,。
該公司的Mitrion Virtual Processor 及Mitrion Software Development Kit讓客戶能利用FPGA超級計(jì)算機(jī)技術(shù)，管理關(guān)鍵程序,，而且符合成本效益,，經(jīng)濟(jì)實(shí)惠。而Mitrion Platform更是個(gè)獨(dú)一無二的FPGA程序方案,，其設(shè)計(jì)減低了對電路設(shè)計(jì)技術(shù)的要求,，令新興市場內(nèi)所有科學(xué)家與發(fā)展商都能享用FPGA超級計(jì)算機(jī)的優(yōu)越性能。
Mitrionics與Cray,、 Nallatech及Silicon Graphics 均已建立重要業(yè)務(wù)聯(lián)系,。
