2003年4月人類基因組圖譜基本繪制完成,，但對基因的調(diào)節(jié)與功能問題仍未能解讀,。由于基因的功能主要是通過其編碼的蛋白質(zhì)來實現(xiàn),，蛋白質(zhì)才是生命活動真正的執(zhí)行者，所以越來越多的科學家致力于蛋白質(zhì)的研究,，試圖找出人類疾病的致病機理,，最終解決人類的疾病。
研究蛋白質(zhì)的技術(shù)也越來越多,，也日趨成熟,。質(zhì)譜技術(shù)由于具有極高的靈敏度而成為蛋白質(zhì)組研究的核心工具，是目前蛋白質(zhì)組研究技術(shù)中最具活力和潛力的技術(shù),。例如收集低豐度的蛋白以及更充分的利用基因組和元基因組數(shù)據(jù)庫的分析,；還有目前大規(guī)模分離蛋白質(zhì)的最有效的方法—雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳；液體套色版,；同位素標簽,；表面放大激光法以及蛋白質(zhì)芯片技術(shù)等等。這些都為生物醫(yī)學研究和提取有用信息提供了研究方法,，高通量的蛋白質(zhì)組學技術(shù)結(jié)合先進的生物信息學分析廣泛應用在基于蛋白途徑的疾病分析信號的識別,。
但是由于蛋白質(zhì)的研究不同于DNA以及RNA，它常有更為復雜的二級,，三維結(jié)構(gòu),；另一方面蛋白質(zhì)不能像DNA那樣可以擴增，因此少量的蛋白很難被檢測到,，這些都給我們的研究帶來了很大的困難,。
盡管如此，蛋白質(zhì)組學研究已在醫(yī)學領(lǐng)域中顯示出其廣泛的應用前景,，而且其技術(shù)及應用還在不斷突破中,。通過蛋白質(zhì)組研究，將為人們更完整地提示生長,、發(fā)育和代謝調(diào)控等生命活動的規(guī)律和嚴重疾病的發(fā)生機制,，為人類進行疾病的診斷防治和新藥開發(fā)提供重要的理論基礎(chǔ)。
