在國家863計劃支持下,，我國蛋白質(zhì)組技術(shù)研究進展順利,，構(gòu)建了1737個基因高表達載體，純化了458個蛋白表達產(chǎn)物,，獲得了126個可供衍射數(shù)據(jù)收集的蛋白質(zhì)結(jié)晶（包括微晶）,，測定了69個蛋白質(zhì)和具有重要意義的蛋白質(zhì)復(fù)合物三維結(jié)構(gòu)（包括6個核磁分析的結(jié)構(gòu)）。解析了人細胞漿內(nèi)NADP+依賴型的異檸檬酸脫氫酶及其輔酶NADP+的復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu);  測定了一個潛在的藥物靶蛋白—PDF（鉤端螺旋體去甲?；福┮约癙DF與actinonin（一種天然的PDF抑制劑）結(jié)合復(fù)合物的X射線晶體結(jié)構(gòu),。人色氨酰-tRNA合成酶、人上游轉(zhuǎn)錄因子(hUBF)等重要蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能研究也取得了重要進展,。SARS冠狀病毒蛋白酶3cl及其復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu)解析成功,，受到國際同行的關(guān)注與好評。

        隨著我國蛋白質(zhì)組研究隊伍的不斷壯大,，我國蛋白質(zhì)組研究的重心也逐步從最初的以建立技術(shù)平臺,，開展技術(shù)方法的研究、整合為主,，逐步向以高通量的蛋白質(zhì)組研究技術(shù)平臺為基礎(chǔ),。一批與重大疾病和重要生物功能相關(guān)的蛋白質(zhì)組研究已經(jīng)取得明顯進展,一批高質(zhì)量的研究論文先后在國際蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的《自然》等刊物上發(fā)表。

        蛋白質(zhì)相互作用,、大規(guī)模ORF克隆,、高通量的質(zhì)譜分析,、大規(guī)模測序技術(shù)、功能研究,、生物信息學(xué),、抗體中心等技術(shù)和平臺逐步建立和完善。我國獨立主持國際“人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃”,，參加國際人類蛋白質(zhì)組研究計劃中的“大規(guī)?？贵w制備”項目。