隨著結(jié)構(gòu)基因組的發(fā)展,，對(duì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,，預(yù)測(cè),，注釋的工具的應(yīng)用和發(fā)展越來(lái)越重要了。在這篇review中作者從四個(gè)方面介紹了這個(gè)領(lǐng)域近來(lái)的發(fā)展：特異的結(jié)構(gòu)比對(duì)（specifically structure alignment）,，進(jìn)化距離遠(yuǎn)的同源及類似蛋白的檢測(cè)（detection of remote homologs and analogs）,，同源建模（homology modeling）和從結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)功能（use of structures to predict function）。作者還對(duì)結(jié)構(gòu)基因組的各種理論進(jìn)行了探討,，包括基于結(jié)構(gòu)的序列空間聚類和基因組范圍的功能識(shí)別等,。