基因芯片技術(shù)是90年代中期以來影響最為深遠(yuǎn)的重大科技進(jìn)展之一,，是融微電子學(xué),、生物學(xué)、物理學(xué),、化學(xué),、計(jì)算機(jī)科學(xué)為一體的高度交叉的新技術(shù)，具有重大的基礎(chǔ)研究價(jià)值,，又具有明顯的產(chǎn)業(yè)化前景,。作為芯片業(yè)界領(lǐng)頭羊的Affymetrix芯片產(chǎn)品，以其卓越的品質(zhì),，受到了廣大科研工作者的青睞,。自1993年以來，世界各地采用 Affymetrix GeneChip技術(shù)平臺發(fā)表的論文高達(dá)2700多篇,，其中包括《Science》45篇,，《Nature》24篇，《Cell》16篇,。最近,，Affymetrix公司的 The GeneChip System 3000Dx (GCS 3000Dx)系統(tǒng)通過了歐盟CE認(rèn)證，成為世界上第一套被批準(zhǔn)用于臨床診斷的芯片系統(tǒng),，同時由于芯片技術(shù)的獨(dú)特優(yōu)勢和產(chǎn)品的卓越表現(xiàn),，Affymetrix公司在全球基因芯片生產(chǎn)廠家中第一家通過了ISO國際標(biāo)準(zhǔn)認(rèn)證。
基因芯片技術(shù)特點(diǎn)
--- GeneChip 獨(dú)特的原位光刻技術(shù),，定量分析,、重復(fù)性好
--- GeneChip 獨(dú)特的PM-MM探針專利設(shè)計(jì)，有效解決芯片非特異雜交問題,，真正提高檢測的靈敏度和特異性
--- GeneChip 表達(dá)譜芯片獨(dú)特的每一個基因多段25mer探針設(shè)計(jì),，有效區(qū)分同源序列，極大提高檢測的特異性和準(zhǔn)確性
--- GeneChip Genotyping芯片對每個SNP位點(diǎn)進(jìn)行40次獨(dú)立的檢測,，保證檢測的準(zhǔn)確性
--- 單色熒光信號適于多張芯片結(jié)果的靈活比較,，降低用戶成本
--- 強(qiáng)大的網(wǎng)上數(shù)據(jù)分析功能，為后續(xù)功能研究提供有力保障
Affymetrix豐富的芯片種類
--- 表達(dá)譜芯片,，應(yīng)用于多種模式生物全基因組的表達(dá)譜研究
包括人,、大鼠、小鼠,、犬,、斑馬魚、爪蟾、果蠅,、瘧原蟲/按蚊,、線蟲、酵母,、擬南芥,、大麥、葡萄,、大豆,、大腸桿菌、綠膿桿菌,、枯草桿菌,、金葡球菌；水稻,、小麥,、雞等20余種生物，是目前覆蓋物種范圍最全的基因芯片平臺,。
--- Genotyping芯片,，應(yīng)用于人類全基因組的單核苷酸多態(tài)性(SNP)研究
利用Affymetrix人類全基因組SNP芯片,僅需250ng起始DNA，一條引物,，一次PCR反應(yīng)便可獲得10000 - 100000個SNP位點(diǎn)的信息,。獨(dú)特的芯片設(shè)計(jì)保證了99.96%的高重復(fù)性。
--- 測序芯片
Affymetrix推出一系列DNA測序芯片：為羅氏制藥度身定做的CYP450藥檢芯片,；用于腫瘤機(jī)制研究的人類線粒體編碼區(qū)測序芯片,；還開發(fā)出SARS測序芯片，18種病原體檢測芯片,，健康檢測型芯片p53,、HIV…
---客戶定制芯片
根據(jù)用戶實(shí)際需要，量身定做特殊用途的芯片,，提交序列后60個工作日即可完成芯片的設(shè)計(jì),、制備和檢測
--- 即將推出的全新概念芯片
Splicing Variants GeneChip：可變剪切子芯片，探究更真實(shí)的基因事件
Whole-transcriptome GeneChip：轉(zhuǎn)錄組芯片,，真正做到全轉(zhuǎn)錄組研究
Affymetrix基因芯片操作平臺——1套系統(tǒng),，便可完成多物種的表達(dá)譜分析、人類SNP分析,、高通量測序分析
---專用芯片雜交箱 Hybridization Oven 640
---全自動洗滌工作站 Fluidics Station 450
---高分辨率芯片分析檢測系統(tǒng)（GeneChip Scanner 3000）
Affymetrix配套軟件
GeneChip® Operating Software (GCOS),，Version 1.2 ——實(shí)現(xiàn)完全的儀器控制、準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)分析和完整的數(shù)據(jù)管理功能,。
Affymetrix Data Mining Tool(DMT),，Version 3.0 ——GCOS 獲得數(shù)據(jù)之后,，交給DMT，為表達(dá)譜芯片提供高級數(shù)據(jù)分析
Affymetrix GeneChip DNA Analysis Software(GDAS),，Version 3.0 ——GCOS獲得數(shù)據(jù)之后,，交給GDAS，為測序芯片,，SNP芯片提供高級數(shù)據(jù)分析
Avadis（Strand Genomics公司生產(chǎn),，表達(dá)譜高級數(shù)據(jù)分析軟件）
提供動態(tài)交互的可視操作界面，可同時打開并觀察多個數(shù)據(jù)
提供多種統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)工具: paired and unpaired T-test, Mann-Whitney tests, One-way and two-way ANOVA, Repeated Measures tests, and PCA.
多種公認(rèn)的聚類分析方法：k-means clustering, Hierarchical, Self-organizing maps, Random Walk, and more
建立多種圖形：2D和3D散點(diǎn)圖,，直方圖，信號通路圖,，功能分類圖
提供多種注釋信息： GO browser, PubMed Correlation Matrix and Pathway viewer.
