華盛頓大學(xué)的計(jì)算機(jī)研究人員已經(jīng)開始應(yīng)用他們開發(fā)出的一種專門研究線蟲基因組的新軟件,,并且已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了先前用其他基因組分析方法漏掉的150個(gè)基因,。而且,利用這種軟件,,研究人員預(yù)測還有存在多達(dá)1119個(gè)基因,。Brent和同事將他們的發(fā)現(xiàn)公布在2005年4月的Genome Research上。
Michael Brent博士用在秀麗隱桿線蟲基因組上的分析軟件叫做TWINSCAN,。另外一種線蟲C.briggsea的基因組還被用于確定兩個(gè)種的最近的共同祖先發(fā)生變化的序列部分。首先,,他發(fā)現(xiàn)TWINSCAN能夠精確預(yù)知60%的線蟲基因組中的基因,。
線蟲是動物發(fā)育和遺傳學(xué)研究的生物學(xué)模型,并且是第一個(gè)完成測序的動物基因組,。線蟲研究人員依靠的是一個(gè)叫做WormBase的基因組數(shù)據(jù)庫,。除了確定的基因外,WorBase還包括成千上萬個(gè)預(yù)測到但沒有來自cDNA或表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)的確切證據(jù)的基因。Brent和同事認(rèn)為WormBase的精確性可以通過使用TWINSCAN預(yù)測加以改善,,而且他們還預(yù)言人類基因組預(yù)測者的年代正在過去,,未來屬于計(jì)算機(jī)破譯的年代。
由于計(jì)算機(jī)速度的不斷提高,,線蟲TWINSCAN分析能夠用于比先前分析方法更精確的內(nèi)含子長度模型(記者楊淑娟),。