華盛頓大學(xué)的計(jì)算機(jī)研究人員已經(jīng)開(kāi)始應(yīng)用他們開(kāi)發(fā)出的一種專(zhuān)門(mén)研究線(xiàn)蟲(chóng)基因組的新軟件,,并且已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了先前用其他基因組分析方法漏掉的150個(gè)基因。而且,,利用這種軟件,,研究人員預(yù)測(cè)還有存在多達(dá)1119個(gè)基因,。Brent和同事將他們的發(fā)現(xiàn)公布在2005年4月的Genome Research上。
Michael Brent博士用在秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)基因組上的分析軟件叫做TWINSCAN,。另外一種線(xiàn)蟲(chóng)C.briggsea的基因組還被用于確定兩個(gè)種的最近的共同祖先發(fā)生變化的序列部分,。首先,他發(fā)現(xiàn)TWINSCAN能夠精確預(yù)知60%的線(xiàn)蟲(chóng)基因組中的基因,。
線(xiàn)蟲(chóng)是動(dòng)物發(fā)育和遺傳學(xué)研究的生物學(xué)模型,,并且是第一個(gè)完成測(cè)序的動(dòng)物基因組。線(xiàn)蟲(chóng)研究人員依靠的是一個(gè)叫做WormBase的基因組數(shù)據(jù)庫(kù),。除了確定的基因外,,WorBase還包括成千上萬(wàn)個(gè)預(yù)測(cè)到但沒(méi)有來(lái)自cDNA或表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)的確切證據(jù)的基因。Brent和同事認(rèn)為WormBase的精確性可以通過(guò)使用TWINSCAN預(yù)測(cè)加以改善,,而且他們還預(yù)言人類(lèi)基因組預(yù)測(cè)者的年代正在過(guò)去,,未來(lái)屬于計(jì)算機(jī)破譯的年代。
由于計(jì)算機(jī)速度的不斷提高,,線(xiàn)蟲(chóng)TWINSCAN分析能夠用于比先前分析方法更精確的內(nèi)含子長(zhǎng)度模型(記者楊淑娟),。