對人類轉錄體的大量創(chuàng)新性的分析,,提高了目前被認為是在基因間的基因組區(qū)域產(chǎn)生大量轉錄物的可能性。
隨著人類基因組測序的完成,,以及密度不斷增加的新型芯片被引入到應用中,,人們逐漸能夠對基因組開展大規(guī)模的分析工作了。但是令人驚奇的是,,在Affymetrix 公司的Thomas Gingeras研究小組,,最近在《科學》雜志上發(fā)表了一篇研究論文,他們雄心勃勃地宣稱在對5—核苷進行分解的基礎上,,己經(jīng)完成了對10個人類染色體轉錄物的作圖工作,。
這一分解作用增加了檢測短的轉錄物的可能性,并且該分解作用是通過將25—核苷探針設計成瓦狀排列完成的,,在10個染色體的無重復系列中,,該探針以每5個堿基對為間隔。該研究小組用98個芯片組成大約7400萬個探針對,,檢測了大約30%的人類基因組,。他們對來自于8個不同細胞系的胞質多聚腺苷酸RNA進行了分析,并對其中一個細胞系的細胞質和細胞核的多聚(A)+和多聚(A)-的轉錄物進行了深入研究,。
根據(jù)獲得的令人疑惑的分析結果,該研究小組推斷,,盡管大多數(shù)被檢測到的胞質多聚(A)+轉錄物在基因組區(qū)作圖時,,外顯子和基因含量很高,但它們中的大約30%似乎來自于目前未知的基因組區(qū),。通過5’和3’ RACE(cDNA末端快速擴增)以及cDNA克隆,,在對這些轉錄物的隨機片段進行結構分析之后,研究小組認為DNA雙鏈都被轉錄是很正常的現(xiàn)象,。出人意料的不僅僅是多聚(A)-轉錄物如此之多,,而且研究小組估計,這些轉錄物可能占人類轉錄體的一半,,它們可能同樣來自于目前已知的區(qū)域和基因間區(qū)域,。
許多研究者認為,目前對人類基因組的深入研究尚未完成,,并且最近有不少報道指出,,人類基因組可能存在更多基因。但是隨著目前研究的進行,,人們推斷轉錄區(qū)域的實際范圍超出了以前的預測范圍,。這一驚奇的發(fā)現(xiàn)提出了許多問題,,雖然芯片研究結果僅僅是個開始而并非最終的答案,但是未來對生命起源和大量新轉錄物的生物功能的研究,,一定會帶來令人激動的新發(fā)現(xiàn),。
REFERENCES
Genove, G. et al. A new transgene reporter for in vivo magnetic resonance imaging. Nat. Med., 11, 450?454 (2005). | Article | PubMed | ChemPort |