生物谷報道：器官如何發(fā)揮功能,？至少從蛋白質組學水平上認為這與蛋白質間相互作用網(wǎng)絡有很大的關系，了解人類細胞內蛋白質相互作用網(wǎng)絡圖譜有助于人類更深認識了蛋白質組學在功能性器官中的價值,。在9月1日出版的電子版Cell上,，德國海德堡的科學家報道這一最新進展。這一研究成果是首次大規(guī)模研究人類蛋白質間相互作用的實驗,，這一研究成果不僅為今后大規(guī)模研究人類不同的細胞組分（如線粒體,，細胞膜，細胞核等）的蛋白質間相互作用提供了技術支持,，也提供了可參照模型,，這將大大失推動了人類對蛋白質組學網(wǎng)絡的認識。而且隨著研究的深入,，蛋白質間相互作用的圖譜逐漸揭示,，生物信息學的不斷發(fā)展，將帶到生命科學領域的巨大變革,！
為系統(tǒng)檢測人類蛋白質間相互作用,，采用了4456個誘餌蛋白和5632個獵物蛋白,，采用酵母雙雜交方法進行研究。結果,，在1705種蛋白質間之間確定了3186種新的相互作用關系,。同時采用免疫共沉淀和Pull-down驗證了這一結果。再通過拓撲學等評價,，至少在401種蛋白質間有911種相互作用聯(lián)系,，是十分可信的，在評估中得分很高,。
進一步研究這些蛋白質間相互作用與人類疾病的關系,。發(fā)現(xiàn)了至少兩個新的與Axin-1相互作用的蛋白質ANP32A和CRMP1能夠調節(jié)Wnt信號通路，從而影響了發(fā)育,，腫瘤等,。雖然這僅僅篩選了這兩個新蛋白，但可以肯定的是,，這篇研究成果中包含有大量的重要信息有待更深入地發(fā)掘,，相信能帶來更多有價值的信息。下面是蛋白質間相互作用的網(wǎng)絡圖譜的示意圖：
(A) A graph of the HC interaction network involving 401 proteins linked via 911 interactions. Orange: disease
proteins (according to OMIM morbidmap, NCBI); light blue: proteins with GO annotation; yellow: proteins without
GO and disease annotation. Interactions connecting the nodes are represented by color-coded lines according to their
confidence scores. Green: 3 quality points; blue: 4 quality points; red: 5 quality points; purple: 6 quality points.
(B) Y2H proteins linked to the Wnt signaling pathway. Spheres: proteins annotated in the KEGG regulatory pathway
(blue); proteins with high-confidence Y2H interactions (light blue); proteins with MC or LC PPIs (white). Links:
protein-protein relations annotated in the Wnt pathway (brown); PPIs from HPRD (black); Y2H HC PPIs (red); Y2H
LC and MC PPIs (gray). The proteins CRMP1, ANP32A, and KIAA1377 bridge two proteins in the Wnt pathway.
生物谷專家認為,，隨著功能蛋白質組學的研究不斷深入,，更多的蛋白質間相互作用網(wǎng)絡被揭示，更多地蛋白質間相互作用形成新的網(wǎng)絡信號通路,，信號通路網(wǎng)絡交織在一起就構成了細胞的真實生命圖景,。將來的系統(tǒng)生物學將逐步揭示這些復雜相互作用的最終奧秘。
原文來源：
Stelzl et al. A Human Protein-Protein Interaction Network: A Resource for Annotating the Proteome. Summary] [Supplemental data] [PDF全文下載]
(全文解壓縮密碼www.bioon.com)
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