生物谷報(bào)道：器官如何發(fā)揮功能,？至少?gòu)牡鞍踪|(zhì)組學(xué)水平上認(rèn)為這與蛋白質(zhì)間相互作用網(wǎng)絡(luò)有很大的關(guān)系，了解人類細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖譜有助于人類更深認(rèn)識(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)在功能性器官中的價(jià)值,。在9月1日出版的電子版Cell上，德國(guó)海德堡的科學(xué)家報(bào)道這一最新進(jìn)展,。這一研究成果是首次大規(guī)模研究人類蛋白質(zhì)間相互作用的實(shí)驗(yàn),，這一研究成果不僅為今后大規(guī)模研究人類不同的細(xì)胞組分（如線粒體，細(xì)胞膜,，細(xì)胞核等）的蛋白質(zhì)間相互作用提供了技術(shù)支持,，也提供了可參照模型，這將大大失推動(dòng)了人類對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)網(wǎng)絡(luò)的認(rèn)識(shí),。而且隨著研究的深入,，蛋白質(zhì)間相互作用的圖譜逐漸揭示，生物信息學(xué)的不斷發(fā)展,，將帶到生命科學(xué)領(lǐng)域的巨大變革,！
為系統(tǒng)檢測(cè)人類蛋白質(zhì)間相互作用，采用了4456個(gè)誘餌蛋白和5632個(gè)獵物蛋白,，采用酵母雙雜交方法進(jìn)行研究,。結(jié)果，在1705種蛋白質(zhì)間之間確定了3186種新的相互作用關(guān)系,。同時(shí)采用免疫共沉淀和Pull-down驗(yàn)證了這一結(jié)果,。再通過拓?fù)鋵W(xué)等評(píng)價(jià),，至少在401種蛋白質(zhì)間有911種相互作用聯(lián)系，是十分可信的,，在評(píng)估中得分很高,。
進(jìn)一步研究這些蛋白質(zhì)間相互作用與人類疾病的關(guān)系。發(fā)現(xiàn)了至少兩個(gè)新的與Axin-1相互作用的蛋白質(zhì)ANP32A和CRMP1能夠調(diào)節(jié)Wnt信號(hào)通路,，從而影響了發(fā)育,，腫瘤等。雖然這僅僅篩選了這兩個(gè)新蛋白,，但可以肯定的是,，這篇研究成果中包含有大量的重要信息有待更深入地發(fā)掘，相信能帶來更多有價(jià)值的信息,。下面是蛋白質(zhì)間相互作用的網(wǎng)絡(luò)圖譜的示意圖：
(A) A graph of the HC interaction network involving 401 proteins linked via 911 interactions. Orange: disease
proteins (according to OMIM morbidmap, NCBI); light blue: proteins with GO annotation; yellow: proteins without
GO and disease annotation. Interactions connecting the nodes are represented by color-coded lines according to their
confidence scores. Green: 3 quality points; blue: 4 quality points; red: 5 quality points; purple: 6 quality points.
(B) Y2H proteins linked to the Wnt signaling pathway. Spheres: proteins annotated in the KEGG regulatory pathway
(blue); proteins with high-confidence Y2H interactions (light blue); proteins with MC or LC PPIs (white). Links:
protein-protein relations annotated in the Wnt pathway (brown); PPIs from HPRD (black); Y2H HC PPIs (red); Y2H
LC and MC PPIs (gray). The proteins CRMP1, ANP32A, and KIAA1377 bridge two proteins in the Wnt pathway.
生物谷專家認(rèn)為,，隨著功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究不斷深入，更多的蛋白質(zhì)間相互作用網(wǎng)絡(luò)被揭示,，更多地蛋白質(zhì)間相互作用形成新的網(wǎng)絡(luò)信號(hào)通路,，信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)交織在一起就構(gòu)成了細(xì)胞的真實(shí)生命圖景。將來的系統(tǒng)生物學(xué)將逐步揭示這些復(fù)雜相互作用的最終奧秘,。
原文來源：
Stelzl et al. A Human Protein-Protein Interaction Network: A Resource for Annotating the Proteome. Summary] [Supplemental data] [PDF全文下載]
(全文解壓縮密碼www.bioon.com)
專題報(bào)道
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·INTERACT - Protein-Protein interaction db
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