今天上午,國家人類基因組南方研究中心在本市研發(fā)公共服務(wù)平臺(tái)正式向世界公布了300多萬條血吸蟲DNA序列,,這是我國首次向世界發(fā)布大規(guī)模的基因組檢測數(shù)據(jù),,再度為“送瘟神”做出重大貢獻(xiàn),。
血吸蟲病是一種嚴(yán)重危害人體健康的寄生蟲病,在我國的致病蟲種是日本血吸蟲,,分布于江灘,、湖灘和山區(qū)。近年來,,血吸蟲病疫情形勢較為嚴(yán)峻,病人數(shù)居高不下,,部分地區(qū)出現(xiàn)急性血吸蟲病,,全國感染人數(shù)達(dá)80余萬。找到“瘟神”致病和治病的“基因鑰匙”被提到了緊鑼密鼓的日程上,,在科技部“十五”863重大專項(xiàng),、市科委等支持下,南方研究中心和中國疾控承擔(dān),、中科院上海生科院等聯(lián)合攻關(guān)日本血吸蟲的基因研究,。日前,日本血吸蟲基因組的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)終于完成,,今天上午,,隨著衛(wèi)生部、科技部,、中科院和上海市有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)的共同啟動(dòng),,上海市研發(fā)公共服務(wù)平臺(tái)正式向全球公布300多萬條DNA序列,。
這是我國首次對(duì)一個(gè)人體寄生蟲進(jìn)行全基因組測序,,也是我國科學(xué)家首次向全球提供大規(guī)模的基因組序列數(shù)據(jù)。隨著“基因鑰匙”的解開,,現(xiàn)在以基因研究為基礎(chǔ)的免疫診斷,、研制疫苗和開發(fā)基因靶點(diǎn)的新藥等已經(jīng)開始同步進(jìn)行,。
今天上午10時(shí)15分,國家人類基因組南方研究中心等單位,,通過上海市研發(fā)公共服務(wù)平臺(tái)下屬生命科學(xué)與生物技術(shù)數(shù)據(jù)中心,,向全世界公布了由我國自主測序的日本血吸蟲基因組工作框架圖,共計(jì)300多萬條DNA序列供全球科研機(jī)構(gòu)和科學(xué)家共享,。衛(wèi)生部副部長王隴德,、中科院副院長陳竺、上海市副市長嚴(yán)雋琪等啟動(dòng)數(shù)據(jù)共享,。
這不僅是我國首次對(duì)人體寄生蟲展開全基因組測序,,也是我國生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)首次通過國內(nèi)生物信息平臺(tái)向全世界發(fā)布大規(guī)模基因組序列數(shù)據(jù),。
“藍(lán)圖”在握,,有朝一日終可消滅血吸蟲病
用中科院院士,、國家人類基因組南方研究中心執(zhí)行主任趙國屏的話來說,全基因組序列圖是由“生命密碼”畫成的原始“藍(lán)圖”,基因轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜則是“說明書”,,掌握了這一系列基礎(chǔ)數(shù)據(jù)不等于大功告成,。目前,應(yīng)用于免疫診斷,、預(yù)防疫苗和新藥靶點(diǎn)等的研究正在同步進(jìn)行,。
血吸蟲病在我國目前雖然已有較好的藥物治療,但耐藥性已在實(shí)驗(yàn)室里出現(xiàn),,更重要的是,,科學(xué)家始終沒有找到有效的免疫診斷方法和預(yù)防疫苗?;蚪M研究因此被寄予厚望,,期望能幫助科學(xué)界重新理解人(即宿主)與血吸蟲(即寄生蟲)之間的關(guān)系。比如,,血吸蟲病的傳統(tǒng)診斷,,看的是糞便里有沒有蟲卵,既麻煩又不準(zhǔn)確,;基因組研究正努力尋找血吸蟲病的靶分子,,診斷起來無疑更方便、準(zhǔn)確,、細(xì)致,。據(jù)悉,目前的臨床試驗(yàn)已發(fā)現(xiàn)了些許“苗頭”?,F(xiàn)在,,科研人員們可以通過基因組研究,搜索候選蛋白,,供疫苗研發(fā)之用,。有了這前所未有的生物信息資源和分析技術(shù)平臺(tái),我國控制和消除血吸蟲病的戰(zhàn)略目標(biāo)終有實(shí)現(xiàn)之日,。
數(shù)量回升,,“刁鉆小蟲”善遷徙、偽裝和適應(yīng)
日本血吸蟲大概可算是世界上最“刁鉆”的寄生蟲之一了,。這種成蟲長約1.5厘米的“黑白雙煞”——雄蟲偏白,、雌蟲偏黑,因日本學(xué)者于1904年首先鑒定而得名,,最中意住在江灘,、湖灘和山區(qū)。全世界共有5種血吸蟲,在我國的致病蟲種就是日本血吸蟲,,輕則令人消瘦,、貧血,重則導(dǎo)致肝硬化,、肝腹水,,甚至死亡。
在科技部“十五”863重大專項(xiàng),、中科院“知識(shí)創(chuàng)新工程”重要方向項(xiàng)目和上海市科委基礎(chǔ)研究重大專項(xiàng)的共同支持下,,我國啟動(dòng)了“日本血吸蟲基因組和基因功能研究”。
此前,,科研人員在世界上第一次對(duì)日本血吸蟲的不同發(fā)育階段,、性別、表皮和卵殼等進(jìn)行了大規(guī)模蛋白質(zhì)鑒定,。結(jié)果,“生命密碼”泄露了這些“刁鉆小蟲”的“狡猾”:血吸蟲表皮和卵殼中表達(dá)的蛋白,,在排列上與其宿主十分相似,,難怪它能逃避或主動(dòng)對(duì)抗來自宿主的免疫攻擊。