基因表達(dá)的分析對(duì)于生物醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的發(fā)展有相當(dāng)重要的意義,。不過,,由于目前不管是利用基因表達(dá)芯片 (Gene expression microarrays)分析法或是利用同步定量 PCR(QRT-PCR)的分析方式,都存在著跨平臺(tái)數(shù)據(jù)落差的現(xiàn)象,。因此,,美國(guó)哈佛醫(yī)學(xué)院 (Harvard Medical School)的科學(xué)家,,就這個(gè)問題特別在《自然 -生物技術(shù)》(Nature Biotechnology)雜志上發(fā)表了一篇研究論文,,試圖通過比較各種分析基因表達(dá)平臺(tái)的差異,找出可能存在的盲點(diǎn),,從而為相關(guān)研究領(lǐng)域的科學(xué)家提供參考,。
據(jù)該篇論文的主要作者 是Winston Patrick Kuo博士。他領(lǐng)導(dǎo)的研究組收集了10種不同的芯片分析系統(tǒng),,包括Affymetrix ,、Applied Biosystems 、Agilent Technologies,、Compugen,、 GE Healthcare、Mergen ,、MWG BioTech,、 Operon、 academic cDNA和Academic long oligonucleotide array 以及應(yīng)用生物系統(tǒng)(Applied Biosystems) 和羅氏的定量pPCR 系統(tǒng),。研究人員除了深入的了解各類分析基因表達(dá)的系統(tǒng)差異外,,還嘗試建立跨平臺(tái)標(biāo)準(zhǔn)化分析方法。
結(jié)果,研究人員發(fā)現(xiàn),,不同分析系統(tǒng)與不同平臺(tái)之間芯片分析技術(shù)所得到的基因表達(dá)圖譜確實(shí)和同步定量PCR技術(shù)所得到的資料相符合,,而且特別是對(duì)于那些具有高度表達(dá)水平的基因有相當(dāng)穩(wěn)定的一致性結(jié)果。不過,,對(duì)于具有較低表達(dá)量的基因標(biāo)的而言,,各系統(tǒng)間就存在著差異。
研究人員因此認(rèn)為,,不同技術(shù)與不同平臺(tái)之間的分析結(jié)果對(duì)于一些具有正?;顒?dòng)表達(dá)量的基因而言,還不至于有很大的差異,;但是低表達(dá)量的基因活動(dòng)確實(shí)有技術(shù)上的困難,,有待科學(xué)家進(jìn)一步發(fā)展更靈敏的分析技術(shù)來克服。