來自中科院上海分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,，以及中科院上海生化與細(xì)胞研究院蛋白組分析中心等處的研究人員在11月《Nature-Genetics》雜志上的一篇Correspondence比較分析了檢測小鼠基因組外顯子的蛋白組學(xué)和芯片這兩種方法，提供了外顯子研究方面的大量數(shù)據(jù)，也為相關(guān)的研究人員提供了方法學(xué)指導(dǎo),。文章聯(lián)系人為中科院上海生化所吳家睿,。

　　去年Frey,  B.J.等人預(yù)測了114萬小鼠基因組外顯子序列,，其中155,839個(gè)序列是通過外顯子芯片方法和GenRate運(yùn)算法則識(shí)別的,。在這一基礎(chǔ)上，中科院分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室等處的研究人員挑選了74,377個(gè)多肽進(jìn)行了蛋白序列和假設(shè)外顯子的直接比對(duì),。并且為了簡化這一比較,，研究人員篩選了Frey的1,123,691個(gè)外顯子全部的三種positive-strand結(jié)構(gòu)，從中理論性的翻譯了6,949,321個(gè)假設(shè)多肽——包含至少6個(gè)氨基酸,。

　　最后研究人員發(fā)現(xiàn)以質(zhì)譜技術(shù)為基礎(chǔ)的蛋白組學(xué)分析方法與以芯片技術(shù)為基礎(chǔ)的分析方法在檢測外顯子方面結(jié)果基本一致,，而且其中的蛋白組學(xué)方法可以用于直接檢測通過gene-mining運(yùn)算方法預(yù)測的外顯子，也被證明了可以成功用于檢測高豐度外顯子,。