美國(guó),、法國(guó),、冰島三國(guó)的科學(xué)家近日利用一種新的技術(shù),分別在小鼠和人類身上確定出了與肥胖有關(guān)的基因網(wǎng)絡(luò),。這比追蹤單個(gè)致病基因的傳統(tǒng)方法要全面得多,,并且已經(jīng)被用于確定新的藥靶。相關(guān)兩篇論文3月16日在線發(fā)表于《自然》(Nature)上,。
領(lǐng)導(dǎo)此次研究的是美國(guó)羅賽特制藥公司(Rosetta Inpharmatics)的Eric Schadt,。他將傳統(tǒng)的方法比作尋找疾病的簡(jiǎn)單基因開(kāi)關(guān)——只要簡(jiǎn)單地開(kāi)啟或關(guān)閉這個(gè)基因就可能導(dǎo)致更高或更低的疾病風(fēng)險(xiǎn)。新方法則著眼于已知基因的表達(dá)變化上,,找到與疾病有關(guān)的基因網(wǎng)絡(luò),,而不是單個(gè)的基因開(kāi)關(guān)。
研究小組與冰島的deCODE公司合作,,從幾百個(gè)冰島人身上收集了血液和脂肪樣本,。分析了每個(gè)樣本中23720個(gè)已知基因的表達(dá)情況,并將結(jié)果與每個(gè)參與者的身體質(zhì)量指數(shù)對(duì)應(yīng)起來(lái),。
在控制與肥胖有關(guān)的常見(jiàn)混淆因素(如年齡,、性別等)之后,研究人員發(fā)現(xiàn)肥胖人的血細(xì)胞中有2000種基因的表達(dá)水平改變了,,而在脂肪組織中有超過(guò)17000種這種基因,。研究人員還在基因表達(dá)數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)共有的模式,這使他們能夠?qū)⑦@些基因組織成一個(gè)共同調(diào)節(jié)的基因網(wǎng)絡(luò),。
接下來(lái),,研究人員在基因組中尋找額外的DNA序列變異,這些變異與基因表達(dá)的某些變化有關(guān),。應(yīng)用這種方法,,研究人員發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個(gè)DNA變異,其中大部分都位于表達(dá)水平發(fā)生改變的基因附近,。
研究結(jié)果證實(shí),,超重是可遺傳的——在脂肪細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的基因表達(dá)水平改變中有70%是可遺傳的;同時(shí)也確定了免疫系統(tǒng)在肥胖等代謝紊亂中的重要作用——小鼠實(shí)驗(yàn)證明一組與肥胖有關(guān)的基因同時(shí)也與炎癥有關(guān),。
這一研究結(jié)果也可用來(lái)為其它疾病確定新藥靶,。美國(guó)加州大學(xué)洛杉磯分校的生物統(tǒng)計(jì)學(xué)家Chiara Sabatti說(shuō):“通過(guò)‘網(wǎng)絡(luò)’的觀點(diǎn),,你能夠增加機(jī)會(huì),發(fā)現(xiàn)你所感興趣的導(dǎo)致‘顯型’的基因,。”
Schadt說(shuō),,這一“基因?qū)ふ?rdquo;技術(shù)已經(jīng)被公司采用,“我們并不是僅僅關(guān)注一個(gè)基因,,因?yàn)樗鼈兛赡軣o(wú)法成藥,。我們考慮什么是最好的節(jié)點(diǎn),或者說(shuō)信息控制點(diǎn),。我們要弄清能最大程度影響基因網(wǎng)絡(luò)的開(kāi)關(guān)是什么,。”
法國(guó)里爾生物學(xué)研究所的生物學(xué)家Christian Dina表示,其它一些實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)加快了使用這項(xiàng)技術(shù)的步伐,。他說(shuō):“這確實(shí)是一個(gè)非常大的進(jìn)步,。”他預(yù)測(cè)這將加速遺傳變化導(dǎo)致疾病方式的確定過(guò)程。(科學(xué)網(wǎng) 梅進(jìn)/編譯)
生物谷推薦原始出處:
(Nature),,doi:10.1038/nature06757,,Yanqing Chen,Eric E. Schadt)
(Nature),,doi:10.1038/nature06758,,Valur Emilsson,Eric E. Schadt)