美國、法國,、冰島三國的科學(xué)家近日利用一種新的技術(shù),,分別在小鼠和人類身上確定出了與肥胖有關(guān)的基因網(wǎng)絡(luò),。這比追蹤單個致病基因的傳統(tǒng)方法要全面得多,,并且已經(jīng)被用于確定新的藥靶,。相關(guān)兩篇論文3月16日在線發(fā)表于《自然》(Nature)上。
領(lǐng)導(dǎo)此次研究的是美國羅賽特制藥公司(Rosetta Inpharmatics)的Eric Schadt,。他將傳統(tǒng)的方法比作尋找疾病的簡單基因開關(guān)——只要簡單地開啟或關(guān)閉這個基因就可能導(dǎo)致更高或更低的疾病風(fēng)險,。新方法則著眼于已知基因的表達變化上,,找到與疾病有關(guān)的基因網(wǎng)絡(luò),而不是單個的基因開關(guān),。
研究小組與冰島的deCODE公司合作,,從幾百個冰島人身上收集了血液和脂肪樣本,。分析了每個樣本中23720個已知基因的表達情況,,并將結(jié)果與每個參與者的身體質(zhì)量指數(shù)對應(yīng)起來。
在控制與肥胖有關(guān)的常見混淆因素(如年齡,、性別等)之后,,研究人員發(fā)現(xiàn)肥胖人的血細胞中有2000種基因的表達水平改變了,而在脂肪組織中有超過17000種這種基因,。研究人員還在基因表達數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了一個共有的模式,,這使他們能夠?qū)⑦@些基因組織成一個共同調(diào)節(jié)的基因網(wǎng)絡(luò)。
接下來,,研究人員在基因組中尋找額外的DNA序列變異,,這些變異與基因表達的某些變化有關(guān)。應(yīng)用這種方法,,研究人員發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個DNA變異,,其中大部分都位于表達水平發(fā)生改變的基因附近。
研究結(jié)果證實,,超重是可遺傳的——在脂肪細胞中發(fā)現(xiàn)的基因表達水平改變中有70%是可遺傳的,;同時也確定了免疫系統(tǒng)在肥胖等代謝紊亂中的重要作用——小鼠實驗證明一組與肥胖有關(guān)的基因同時也與炎癥有關(guān)。
這一研究結(jié)果也可用來為其它疾病確定新藥靶,。美國加州大學(xué)洛杉磯分校的生物統(tǒng)計學(xué)家Chiara Sabatti說:“通過‘網(wǎng)絡(luò)’的觀點,,你能夠增加機會,發(fā)現(xiàn)你所感興趣的導(dǎo)致‘顯型’的基因,。”
Schadt說,,這一“基因?qū)ふ?rdquo;技術(shù)已經(jīng)被公司采用,“我們并不是僅僅關(guān)注一個基因,,因為它們可能無法成藥,。我們考慮什么是最好的節(jié)點,或者說信息控制點,。我們要弄清能最大程度影響基因網(wǎng)絡(luò)的開關(guān)是什么,。”
法國里爾生物學(xué)研究所的生物學(xué)家Christian Dina表示,其它一些實驗室已經(jīng)加快了使用這項技術(shù)的步伐,。他說:“這確實是一個非常大的進步,。”他預(yù)測這將加速遺傳變化導(dǎo)致疾病方式的確定過程。(科學(xué)網(wǎng) 梅進/編譯)
生物谷推薦原始出處:
(Nature),,doi:10.1038/nature06757,,Yanqing Chen,,Eric E. Schadt)
(Nature),doi:10.1038/nature06758,,Valur Emilsson,,Eric E. Schadt)