2011年3月24日,,由華大基因和安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院張學(xué)軍教授科研團(tuán)隊(duì)合作研究的成果《利用外顯子測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證了NCSTN基因的突變可導(dǎo)致逆向性痤瘡的發(fā)生》在國際知名雜志Journal of Investigative Dermatology 上在線發(fā)表,這是我國科學(xué)家將外顯子測(cè)序技術(shù)應(yīng)用于單基因病致病基因?qū)ふ业挠忠豁?xiàng)重要成果,,對(duì)NCSTN基因突變的檢測(cè)和逆向性痤瘡及其相關(guān)疾病的診斷,、治療具有十分重要的意義。
逆向性痤瘡(Inversa acne, AI)又名化膿性汗腺炎,,是一種少見的常染色體顯性遺傳病,,以反復(fù)發(fā)生皮膚膿腫、竇道及瘢痕形成為特征性表現(xiàn),。本病多發(fā)生于女性,,由于大汗腺導(dǎo)管閉塞繼發(fā)細(xì)菌感染所致。除皮損外,,AI還可伴發(fā)關(guān)節(jié)炎或者繼發(fā)鱗狀上皮細(xì)胞癌,,不僅對(duì)患者的健康和美觀均有極大影響,而且可造成患者嚴(yán)重的身心負(fù)擔(dān),。
本研究選取了一個(gè)中國漢族人四代家系,,該家系在2006年由張學(xué)軍教授領(lǐng)導(dǎo)的科研團(tuán)隊(duì)利用全基因組掃描結(jié)合連鎖分析的方法,將疾病的致病基因定位于1p21.1-1q25.3區(qū)域,,這項(xiàng)成果在同一雜志(Journal of Investigative Dermatology)發(fā)表,。由于連鎖區(qū)域范圍較大,包含大約900個(gè)基因,,若要進(jìn)行精細(xì)定位,,則需要尋找大的家系,這將是一個(gè)耗時(shí)費(fèi)力的過程,,而外顯子測(cè)序技術(shù)解決了這一難題,。
本研究采用Agilent全外顯子組捕獲芯片并結(jié)合高通量測(cè)序,對(duì)該家系中的兩名患者進(jìn)行外顯子測(cè)序,,平均每個(gè)個(gè)體發(fā)現(xiàn)遺傳變異42,678個(gè),,其中包括34,570個(gè)非同義突變,通過與公共數(shù)據(jù)庫比對(duì)過濾分析并結(jié)合連鎖定位的結(jié)果,,推測(cè)出NCSTN基因的第11個(gè)內(nèi)含子供體位置的突變可能和AI的發(fā)病相關(guān),。后期驗(yàn)證階段,在另一AI家系中發(fā)現(xiàn)該基因的第3號(hào)外顯子存在一個(gè)2bp核苷酸的缺失,;同時(shí),,在這兩個(gè)家系的所有正常對(duì)照和90名正常人中均未發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)突變,從而證實(shí)NCSTN基因與逆向性痤瘡的發(fā)生相關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn)了NCSTN基因的2個(gè)新的突變位點(diǎn),,NCSTN基因編碼的蛋白是γ分泌酶復(fù)合體的四個(gè)亞單位之一,,而γ分泌酶與AI及阿爾采默氏病的發(fā)病密切相關(guān),因此,,該基因突變的檢測(cè)對(duì)AI及其相關(guān)疾病的診斷,、治療具有十分重要和深遠(yuǎn)的意義。
新一代測(cè)序技術(shù)的產(chǎn)生和發(fā)展為疾病研究帶來了新的機(jī)遇,。作為一種高效,、快速和高性價(jià)比的研究方法,外顯子測(cè)序技術(shù)廣泛應(yīng)用于遺傳病的研究,。自2009年以來,,國際頂級(jí)雜志上相繼發(fā)表了多篇將外顯子測(cè)序技術(shù)應(yīng)用于單基因病的研究成果,并已經(jīng)獲得國際單基因病領(lǐng)域科學(xué)家的廣泛認(rèn)可,。目前,,應(yīng)用外顯子測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)并統(tǒng)計(jì)稀有突變?cè)诓煌巳褐械姆植碱l率,并結(jié)合疾病臨床表型等背景知識(shí)在基因?qū)用娼庾x疾病,,已經(jīng)成為疾病研究的趨勢(shì),。(生物谷Bioon.com)
生物谷推薦英文摘要:
Journal of Investigative Dermatology , (24 March 2011)|doi:10.1038/jid.2011.62
Confirmation by Exome Sequencing of the Pathogenic Role of NCSTN Mutations in Acne Inversa (Hidradenitis Suppurativa)
Yuan Liu, Min Gao, Yong-mei Lv, Xu Yang, Yun-qing Ren, Tao Jiang, Xin Zhang, Bi-rong Guo, Min Li, Qing Zhang, Peng Zhang, Fu-sheng Zhou, Gang Chen, Xian-yong Yin, Xian-bo Zuo, Liang-dan Sun, Xiao-dong Zheng, Shu-mei Zhang, Jian-jun Liu, Youwen Zhou, Ying-rui Li, Jun Wang, Jian Wang, Huan-ming Yang, Sen Yang, Rui-qiang Li and Xue-jun Zhang
TO THE EDITORAcne inversa (AI; also known as hidradenitis suppurativa; OMIM #142690) is an autosomal dominantly inherited skin disorder characterized by recurrent draining sinuses and abscesses with subsequent scarring and chronic seepage. It mainly affects the scalp, neck, the axillae, perineum, and inframammary regions, which may lead to social embarrassment and have a profound impact on the quality of life.