6月12日,,國際著名學術期刊《自然—遺傳學》(NatureGenetics)在線發(fā)表了安徽醫(yī)科大學最新研究成果——特應性皮炎(atopicdermatitis,AD)全基因組關聯(lián)研究(Genome-wideassociationstudy,GWAS),,發(fā)現(xiàn)AD易感基因,。該研究由張學軍教授領銜的安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院皮膚病遺傳學研究團隊牽頭,聯(lián)合上海交通大學附屬新華醫(yī)院姚志榮教授研究團隊,、德國基爾大學AndreFranke教授研究團隊等國內外30多家單位共同完成,。
這是目前亞洲地區(qū)首個,、全世界樣本量最大的AD易感基因GWAS研究,,也是該團隊2009年以來繼銀屑病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡,、麻風,、白癜風GWAS研究發(fā)現(xiàn)疾病易感基因后又一項復雜疾病GWAS研究的重大科研成果。該研究為深入揭示AD發(fā)病機制豐富了理論依據(jù),,標志著我國AD易感基因研究躋身世界先進行列,。
特應性皮炎(AD),又稱“異位性皮炎”,,是濕疹的一種特殊類型,,好發(fā)于兒童,具有慢性復發(fā),,病程遷延,,瘙癢劇烈,難以根治等特點,,常伴發(fā)哮喘和過敏性鼻炎等過敏性疾病且多數(shù)患者終身患病,,對患兒的生長發(fā)育和成人的生活質量造成了嚴重影響。AD病因不明,,與遺傳和環(huán)境因素密切相關,。我國AD的發(fā)病率為3%,近年來由于生活環(huán)境的變化,,發(fā)病率呈逐年上升趨勢,,病程的長期性和慢性復發(fā)傾向,,給患者、家庭和社會帶來沉重的負擔,,AD已經(jīng)成為一個嚴重的社會問題,。
該項研究得益于國家“863”計劃、“973”前期研究專項,、國家自然科學基金重點及面上項目,、安徽省財政廳和科技廳專項基金等資助,歷時3年,,通過對近2萬例AD患者和健康對照進行AD易感基因GWAS研究,,在人類基因組2個區(qū)域內發(fā)現(xiàn)了與AD發(fā)病密切相關的易感基因,即5號染色體區(qū)域的TMEM232和SLC25A46,;20號染色體區(qū)域的TNFRSF6B和ZGPAT,;證實了既往在歐洲和亞洲人群報道的AD易感基因FLG。這些基因異常表現(xiàn)將導致AD的發(fā)生,。該研究實現(xiàn)了亞洲人群,、歐美人群的國際性合作,突破了研究人群單一的局限,,研究結果具代表性和科學性,。
GWAS是近幾年興起的搜尋復雜疾病易感基因的最為有效的方法之一,2011年,,《自然》(Nature)在評論重大科學熱點時,,將GWAS發(fā)現(xiàn)疾病易感基因排位第二,并指出利用GWAS發(fā)現(xiàn)了一大批有價值的疾病易感基因/位點,,后續(xù)易感基因功能研究將對闡明人類重大疾病的發(fā)病機制具有重要意義,。
據(jù)悉,5月19-21日《自然—遺傳學》聯(lián)合安徽醫(yī)科大學,,邀請了來自美國國立衛(wèi)生研究院,、deCODE遺傳研究所、美國國家癌癥研究所,、美國哈佛-麻省理工Broad研究所,、清華大學、北京大學等國內外多家知名研究團隊,,在安徽醫(yī)科大學舉辦了《自然—遺傳學》2011年全基因組關聯(lián)研究《機遇與挑戰(zhàn)》的國際高峰論壇,,為進一步推動完善GWAS的全面深入發(fā)展,發(fā)現(xiàn)更多復雜疾病易感基因提供了契機,。論壇一致認為GWAS發(fā)現(xiàn)復雜疾病易感基因卓有成效,,近5年來利用GWAS發(fā)現(xiàn)了近200多種復雜疾病近4000多個疾病易感基因/位點,后續(xù)對疾病易感基因功能研究將為加速推動復雜疾病發(fā)病機制研究進程,,全面揭示人類復雜疾病病因,,推進基礎研究轉化臨床應用奠定了堅實的基礎,。在全基因組測序價格降低到廉價高效之前,GWAS方法由于其自身的優(yōu)勢和效力無疑將是尋找復雜疾病易感基因的最為有效的方法,,在不久的將來人類將會迎來利用GWAS研究復雜疾病新的高潮,,將會發(fā)現(xiàn)越來越多的疾病易感基因。
此次GWAS研究發(fā)現(xiàn)AD易感基因將為人類揭示AD的發(fā)病機制提供了新的契機,,對疾病預警,、遺傳咨詢、臨床診斷及新藥研發(fā)具有重大意義,;同時該研究構建了第一個亞洲人群AD病例-對照的全基因組關聯(lián)研究數(shù)據(jù)庫,,為今后AD易感基因的深入研究并最終全面揭示AD的發(fā)病機制奠定了堅實的基礎。(生物谷Bioon.com)
生物谷推薦原文出處:
Nature Genetics DOI:10.1038/ng.851
Genome-wide association study identifies two new susceptibility loci for atopic dermatitis in the Chinese Han population
Liang-Dan Sun; Feng-Li Xiao; Yang Li; Wen-Ming Zhou; Hua-Yang Tang; Xian-Fa Tang; Hui Zhang; Heidi Schaarschmidt; Xian-Bo Zuo; Regina Foelster-Holst; Su-Min He; Mei Shi; Qiang Liu; Yong-Mei Lv; Xi-Lan Chen; Kun-Ju Zhu; Yi-Feng Guo; Da-Yan Hu; Ming Li; Min Li; Yan-Hong Zhang; Xin Zhang; Jian-Ping Tang; Bi-Rong Guo; Hua Wang; Yuan Liu; Xiao-Yan Zou; Fu-Sheng Zhou; Xiao-Yan Liu; Gang Chen; Lin Ma; Shu-Mei Zhang; Ai-Ping Jiang; Xiao-Dong Zheng; Xing-Hua Gao; Pan Li; Cai-Xia Tu; Xian-Yong Yin; Xiu-Pi
Atopic dermatitis is a chronic, relapsing form of inflammatory skin disorder that is affected by genetic and environmental factors. We performed a genome-wide association study of atopic dermatitis in a Chinese Han population using 1,012 affected individuals (cases) and 1,362 controls followed by a replication study in an additional 3,624 cases and 12,197 controls of Chinese Han ethnicity, as well as 1,806 cases and 3,256 controls from Germany. We identified previously undescribed susceptibility loci at 5q22.1 (TMEM232 and SLC25A46, rs7701890, Pcombined = 3.15 × 10?9, odds ratio (OR) = 1.24) and 20q13.33 (TNFRSF6B and ZGPAT, rs6010620, Pcombined = 3.0 × 10?8, OR = 1.17) and replicated another previously reported locus at 1q21.3 (FLG, rs3126085, Pcombined = 5.90 × 10?12, OR = 0.82) in the Chinese sample. The 20q13.33 locus also showed evidence for association in the German sample (rs6010620, P = 2.87 × 10?5, OR = 1.25). Our study identifies new genetic susceptibility factors and suggests previously unidentified biological pathways in atopic dermatitis.