家養(yǎng)動物向人類提供了穩(wěn)定的動物蛋白來源,，是人類社會由散居、漁獵型向群居,、農(nóng)業(yè)型轉(zhuǎn)變的重要基礎(chǔ)和必然產(chǎn)物,。野生動物被馴化為家養(yǎng)動物后，其擴散是依賴于人類的遷移而實現(xiàn)的,。因此,，對家養(yǎng)動物起源的研究不僅具有其自身的意義，而且對于了解人類社會的發(fā)展也有重要的價值,。

　　中石器時代的考古學(xué)遺址和現(xiàn)代的遺傳學(xué)證據(jù)都提示,，狗可能是第一種被馴化的家養(yǎng)動物，而其歷史也不過大約1.5萬年,。與一般的野生動物相比,，雖然家養(yǎng)動物的歷史非常短，但在強烈的人工選擇作用下,，卻呈現(xiàn)出極其豐富的形態(tài)變異,，遠遠超過了其野生祖先。這為研究選擇的作用及形態(tài)變異的發(fā)育遺傳基礎(chǔ)提供了絕佳的材料,。此外,，家養(yǎng)動物的遺傳多樣性是遺傳育種的物質(zhì)基礎(chǔ)，是人類社會的寶貴資源,。

　　雖然達爾文在《物種起源》一書中就專門論述了家養(yǎng)動物的起源問題,，但在很長的時期中，人們對于家養(yǎng)動物的起源,、進化與遺傳多樣性卻知之甚少,。近年來，隨著基因組計劃的發(fā)展及相關(guān)技術(shù)與信息的運用,，推動了家養(yǎng)動物的研究。

　　對母系遺傳的線粒體基因組的RFLP及線粒體D－環(huán)序列的分析顯示，黃牛,、水牛,、綿羊和豬中均存在兩枝分化顯著的線粒體DNA序列，其分歧時間遠早于家養(yǎng)動物可能的起源時間,，且這兩枝有明顯的東西方地理分化傾向,；研究人員在實驗室獲得的有限的核基因信息也顯示類似的趨向。這些研究結(jié)果提示,，至少存在東方和西方兩個家養(yǎng)動物起源馴化的中心,。綿羊的情況有所不同，至少存在三枝,，也有一定的地理分布傾向,，提示可能有多個獨立的起源地。馬的情況比較復(fù)雜,，馬的線粒體DNA呈現(xiàn)高度的多樣性,，已發(fā)現(xiàn)的至少17枝的線粒體DNA及其分布情況也提示可能存在多個起源地。有趣的是,，對馬Y染色體非編碼區(qū)14.3kb序列的分析卻沒有發(fā)現(xiàn)任何的多態(tài)位點,，這可能是由于僅有很少數(shù)的雄性種馬參與繁育，即雄性的有效群體遠小于雌性的所致,。狗和雞的起源則與上述動物的不同,，許多實驗室的工作提示，這兩種家養(yǎng)動物可能都是起源于東亞,，然后擴散到其他區(qū)域的,；同時，狗和雞中均存在多枝分化較大的線粒體DNA,，證明有多個母性建群者,。一些家養(yǎng)動物起源上的相似性可能反映了區(qū)域性的人類活動。

　　上述這些工作由于多數(shù)主要依賴于線粒體D環(huán)有限的信息,，加之樣品有限,，還難以提供東西方起源的進一步信息以及建群者數(shù)量。我們在對狗和豬的研究中建立了從線粒體基因組全序列到大樣本的分析策略,，有效地解決了過去序列信息不足及D環(huán)進化噪音較高的問題,，進一步揭示了狗和豬的起源，這將是今后的一個發(fā)展方向,。另一個方向是發(fā)展有效的核基因組標記,，特別是Y染色體標記。在弄清家養(yǎng)動物起源的基礎(chǔ)上,，今后的重要任務(wù)與挑戰(zhàn)是研究人工選擇下家養(yǎng)動物的遺傳進化及其與人類進化的關(guān)系,。