8月6日出版的英國(guó)Genome Biology期刊發(fā)表了中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所李奎教授課題組唐中林博士,、李勇碩士等關(guān)于中外豬種骨骼肌生長(zhǎng)發(fā)育生長(zhǎng)差異分子機(jī)制的重要研究成果,。
豬肉是人類動(dòng)物蛋白的主要來(lái)源,我國(guó)是世界上生豬生產(chǎn)和豬肉消費(fèi)的第一大國(guó),。我國(guó)種豬長(zhǎng)期依賴進(jìn)口,,西方豬種雖生長(zhǎng)快和瘦肉率高,但口感風(fēng)味較差,。該問(wèn)題已經(jīng)引起普遍關(guān)注,。我國(guó)地方豬種具有肉質(zhì)優(yōu)良的特點(diǎn),以“鮮嫩多汁”馳名中外,。解析中外豬種骨骼肌生長(zhǎng)發(fā)育差異分子機(jī)制是培育優(yōu)良豬種的基礎(chǔ),。
該研究以我國(guó)地方優(yōu)良豬種—通城豬和著名瘦肉型豬—長(zhǎng)白豬為研究對(duì)象,選取三個(gè)重要時(shí)間點(diǎn)(妊娠33天,、65天和90天)的胚胎骨骼肌,,利用LongSAGE技術(shù)比較分析其全基因組轉(zhuǎn)錄譜,從檢測(cè)的317115個(gè)表達(dá)標(biāo)簽中鑒定了2648個(gè)差異表達(dá)基因,。系統(tǒng)聚類分析發(fā)現(xiàn)兩品種在妊娠65天時(shí)基因表達(dá)差異最大,,且通城豬妊娠65天的胚胎骨骼肌具有獨(dú)特的表達(dá)譜特征。對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行表達(dá)模式和本體論分析,,發(fā)現(xiàn)骨骼肌發(fā)育過(guò)程中差異表達(dá)基因呈現(xiàn)8種不同表達(dá)模式,,每種表達(dá)模式都分別富集了不同類別的功能基因。無(wú)論在表達(dá)模式還是富集的功能類別上,,兩品種的表達(dá)基因都存在很大差異。細(xì)胞生物學(xué)合成,、細(xì)胞增殖調(diào)控,、有機(jī)酸代謝、大分子生物合成,、調(diào)節(jié)細(xì)胞大小等相關(guān)基因多在通城豬骨骼肌發(fā)育過(guò)程中差異表達(dá),。此外,還發(fā)現(xiàn)通城豬骨骼肌的發(fā)育涉及到了更多類別功能的功能基因,。
該研究認(rèn)為,,通城豬和長(zhǎng)白豬的基因表達(dá)表型差異顯著,通城豬胚胎骨骼肌具有相對(duì)緩慢的生長(zhǎng)速度和更復(fù)雜的分子機(jī)制,而增加細(xì)胞生長(zhǎng)和成肌細(xì)胞生存的基因在長(zhǎng)白豬中表達(dá)上調(diào),。他們還推測(cè),,妊娠65天可能是導(dǎo)致兩品種生長(zhǎng)性狀差異顯著的重要時(shí)間點(diǎn)。
該研究由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所,、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物遺傳育種與繁殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,、上海華冠生物芯片有限公司共同完成,全部工作均在國(guó)內(nèi)完成,。此項(xiàng)研究是國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目資助課題,,并得到國(guó)家863和973計(jì)劃資助。
原始出處:
http://genomebiology.com/2007/8/6/R115