中國科學(xué)院植物研究所系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)開放實(shí)驗(yàn)室等六家單位的一項(xiàng)研究顯示,,有三個(gè)位點(diǎn)上的氨基酸置換在非典(SARS)病毒適應(yīng)性進(jìn)化中具有重要作用。
SARS-CoV跨種傳播過程中,,Spike蛋白的非保守性氨基酸置換可能使該病毒適應(yīng)新宿主是一個(gè)重要的假說,。為了檢驗(yàn)該假說,,研究人員收集了GenBank數(shù)據(jù)庫中共計(jì)108條SARS-CoV的S基因全序列(截至2004年3月23日),采用鄰接法重建系統(tǒng)樹,。該樹將序列明確地劃分為兩組∶一組是2003年的獸源毒株,,另一組是2002~2003年流行期間的人源毒株。在此基礎(chǔ)上,,重建了這兩組各自的最近共同祖先序列并對(duì)其編碼的Spike蛋白進(jìn)行適應(yīng)性進(jìn)化檢測(cè),。
結(jié)果表明,上述兩條最近共同祖先序列相差13個(gè)非同義置換,,而沒有同義置換,。在相應(yīng)的13個(gè)氨基酸置換中,,前8個(gè)在Spike蛋白的S1區(qū)域中,其中360,479和487這3個(gè)位點(diǎn)位于受體結(jié)合域內(nèi),,而后5個(gè)則在S2區(qū)域中,。適應(yīng)性進(jìn)化檢測(cè)表明這13個(gè)非同義置換在體積、色譜指數(shù),、可溶性減速率和轉(zhuǎn)角形成趨勢(shì)這4種性質(zhì)上都存在著傾向于非保守性變化的選擇效應(yīng),。特別是在360、665和701這3個(gè)位點(diǎn)上的氨基酸置換在Spike蛋白的適應(yīng)性進(jìn)化中可能起到重要作用,。