在2007年1月出版的《自然—方法學(xué)》上,研究人員報(bào)告了一種分析細(xì)胞遺傳信息的新技術(shù),為綜合研究人類(lèi)腸道內(nèi)的所有細(xì)菌打開(kāi)了一扇門(mén)。新技術(shù)讓研究人員能夠捕獲和分析細(xì)菌世界的寄生蟲(chóng),這種寄生蟲(chóng)的遺傳信息通常會(huì)逃脫普通的檢查,。
對(duì)許多生物來(lái)說(shuō),一旦測(cè)出其基因組序列,,那么就可獲得確定重要功能基因的所有信息,。然而,對(duì)細(xì)菌世界來(lái)說(shuō)情況并非如此,。許多細(xì)菌攜帶有寄生基因,,它們儲(chǔ)藏在名為質(zhì)粒的小圓形DNA分子中。質(zhì)粒不僅含有表達(dá)細(xì)胞新功能的基因,,而且這些質(zhì)粒的復(fù)制本也可被轉(zhuǎn)移給其他細(xì)菌,。
絕大多數(shù)試圖確定生態(tài)系統(tǒng)中微生物特征的大型測(cè)序工作都不適合分析可提供額外基因的質(zhì)粒復(fù)合群體。Julian Marchesi和同事描述了一種選擇性捕獲細(xì)菌寄生蟲(chóng)的方法,,這樣就可以對(duì)這些寄生蟲(chóng)進(jìn)行測(cè)序,。他們?cè)谌梭w腸內(nèi)的細(xì)菌生態(tài)系統(tǒng)中試驗(yàn)了這種方法,發(fā)現(xiàn)質(zhì)粒中含有已知和未知的功能,。這種方法有助于確定這些小寄生蟲(chóng)的重要性以及它們對(duì)微生物生態(tài)系統(tǒng)的影響,。