微生物學(xué)通報(bào) SEP 20, 2008, 35(9): 1433~1438
副粘病毒Tianjin株NP,、P,、M及L蛋白的生物信息學(xué)分析
石立瑩 李 梅 李曉眠* 何健民 袁立軍
(天津醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室 天津 300070)
摘 要: 為了進(jìn)一步明確副粘病毒Tianjin株的來源和種系進(jìn)化地位, 探討其高致病性的機(jī)制。對(duì)Tianjin株NP,、P,、M及L蛋白進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。進(jìn)化樹顯示：Tianjin株屬于副粘病毒亞科呼吸道病毒屬, 且很可能為仙臺(tái)病毒新的基因型,。相似性比較表明, P蛋白變異最大, 相似性僅為78.7%~91.9%; L蛋白相似性最高, 為96.0%~98.0%,。序列比對(duì)顯示：NP蛋白氨基酸序列中存在15個(gè)獨(dú)特的變異位點(diǎn), P蛋白存在29個(gè), M蛋白存在6個(gè), L蛋白存在29個(gè)。這些獨(dú)特變異位點(diǎn)的存在很可能是導(dǎo)致Tianjin株在宿主來源和致病特點(diǎn)等方面與已知仙臺(tái)病毒株具有較大差異的原因,。
關(guān)鍵詞: 副粘病毒, 仙臺(tái)病毒, 狨猴, 生物信息學(xué)
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