據(jù)1月22日的《科學(xué)》雜志報道說,,應(yīng)用新的基因組測序技術(shù),,科研人員對被稱作MRSA的抗藥性金黃色葡萄球菌進行了追蹤,該細菌在過去的40年中在全世界范圍內(nèi)都在擴散,。 這一研究以及其所用的方法能夠幫助研究人員跟蹤MRSA在國家之間,、兩個醫(yī)療機構(gòu)之間及在個體之間(例如在某一單一的諸如醫(yī)院病房這樣的地方)傳播的途徑。 該項工作可能還會有助于確認感染控制策略在哪些方面需要進行修正或加強以減少MRSA感染發(fā)生的數(shù)量,,并改善探查新出現(xiàn)的菌株并控制其擴散的監(jiān)督策略,。
大多數(shù)的MRSA感染發(fā)生在諸如醫(yī)院或療養(yǎng)院等與醫(yī)療有關(guān)的機構(gòu)之中,,這些感染可能會是致命的。目前的比較采自病人的不同菌株的MRSA的方法無法提供足夠的資訊來準確地勾勒出不同菌株之間的演進關(guān)系,。 Simon Harris以及一個國際團隊的同僚應(yīng)用一種新的方法來繪制許多不同MRSA菌株基因組中的各個點,。在這些點的DNA序列的差別僅僅為幾個“字母”甚或只是一個字母的差異。 科研人員用這種方法來檢驗屬于"ST239"世系的63株MRSA,,它們具有對抗菌素的抵抗力,,并占了全世界與醫(yī)療有關(guān)的MRSA感染中的大部分。 這些樣本中大約有三分之二來自1982-2003年間在全世界采集到的樣本,,從而為人們提供了一個有關(guān)全球ST239種群的獨立觀察,;有三分之一的樣本來自在一個為期7個月的時間段內(nèi)的泰國某一醫(yī)院的患者。 通過分析樣本間的遺傳變異量,,科研人員組建了一個“系譜圖”,,該系譜圖顯示了ST239 克隆是如何擴散到世界的不同區(qū)域的,以及他們在不同國家通過進一步的演化而產(chǎn)生出成簇的在遺傳學(xué)上相似的菌株,。
例如,,結(jié)果顯示,在倫敦某家醫(yī)院的加護病房中所發(fā)生的一起MRSA的感染爆發(fā)非常有可能與從東南亞引入的一個菌株有關(guān),。該事件的發(fā)生只需要由某個人攜帶該菌株從一個地方到例外一個地方,,并在那個地方將細菌傳播給另外一些人,而且這些人中有一些出現(xiàn)發(fā)燒感染,。該研究還顯示,,在某泰國醫(yī)院感染病人的一個單株的MRSA是如何隨著時間的推移而發(fā)生新的變異的;人們有可能分辨在同一病房中的2位感染MRSA的病人是否是由從一個人傳播到另外一個人的菌株的直接傳播所引起,,或是這些菌株的獲得是來自醫(yī)院的其它地方,。這將有助于查明在控制感染的策略中有關(guān)預(yù)防傳播的方面究竟有哪些不足之處。(生物谷Bioon.com)
生物谷推薦原始出處:
Science 22 January 2010:DOI: 10.1126/science.1182395
Evolution of MRSA During Hospital Transmission and Intercontinental Spread
Simon R. Harris,1,* Edward J. Feil,2,* Matthew T. G. Holden,1 Michael A. Quail,1 Emma K. Nickerson,3,4 Narisara Chantratita,3 Susana Gardete,5,6 Ana Tavares,5 Nick Day,3,7 Jodi A. Lindsay,8 Jonathan D. Edgeworth,9,10 Hermínia de Lencastre,5,6 Julian Parkhill,1 Sharon J. Peacock,3,4 Stephen D. Bentley1,
Current methods for differentiating isolates of predominant lineages of pathogenic bacteria often do not provide sufficient resolution to define precise relationships. Here, we describe a high-throughput genomics approach that provides a high-resolution view of the epidemiology and microevolution of a dominant strain of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). This approach reveals the global geographic structure within the lineage, its intercontinental transmission through four decades, and the potential to trace person-to-person transmission within a hospital environment. The ability to interrogate and resolve bacterial populations is applicable to a range of infectious diseases, as well as microbial ecology.
1 The Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 15A, UK.
2 Department of Biology and Biochemistry, University of Bath, South Building, Claverton Down, Bath BA2 7AY, UK.
3 Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand.
4 Department of Medicine, University of Cambridge, Addenbrooke’s Hospital, Cambridge CB2 0QQ, UK.
5 Laboratory of Molecular Genetics, Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Universidade Nova de Lisboa, 2780-156 Oeiras, Portugal.
6 Laboratory of Microbiology, The Rockefeller University, New York, NY 10065, USA.
7 Centre for Clinical Vaccinology and Tropical Medicine, Nuffield Department of Clinical Medicine, University of Oxford, Oxford OX3 7LJ, UK.
8 Centre for Infection, Department of Cellular and Molecular Medicine, St. George’s, University of London, Cranmer Terrace, London SW17 0RE, UK.
9 Department of Infectious Diseases, King’s College London, Guy’s, King’s, and St. Thomas’ Medical School, Guy’s Hospital, London SE1 9RT, UK.
10 Directorate of Infection, Guy’s and St. Thomas’ National Health Service Foundation Trust, London SE1 7EH, UK.