痤瘡俗稱青春痘,，是一種多因素疾病，我們都曾有過這樣的一兩顆小疙瘩,，但有些人卻患有嚴(yán)重的痤瘡,，這會(huì)帶來他們社會(huì)性和身體上的痛苦。然而時(shí)至今日,，造成嚴(yán)重痤瘡的病理原因仍然是一個(gè)謎,，現(xiàn)有的治療方法也并不總是有效。
近期來自加州大學(xué)洛杉磯分校的一組研究人員通過分析患有嚴(yán)重痤瘡病患表面微生物的DNA序列,，提出一般認(rèn)為導(dǎo)致痤瘡的痤瘡丙酸桿菌(Propionibacterium acnes)也許并不是罪魁禍?zhǔn)?，在分析了一些相關(guān)的菌株后，研究人員還發(fā)現(xiàn)了一些能清潔皮膚的細(xì)菌菌種,。這一研究成果公布在2月28日的The Journal of investigative dermatology雜志上,。
領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是加州大學(xué)洛杉磯分校李慧穎（Huiying Li，音譯）,，她指出,，“過去一直認(rèn)為P. acnes是罪魁禍?zhǔn)?rdquo;，然而最新這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)事實(shí)并非如此,，研究人員發(fā)現(xiàn)患有痤瘡的患者和皮膚干凈的對(duì)照組,，其毛孔中的痤瘡丙酸桿菌數(shù)量相似，不同之處在于他們所具有的菌株品種不同,。
“就像酸奶中的細(xì)菌菌株,，對(duì)于腸道有益處，這些痤瘡丙酸桿菌中的一些優(yōu)良菌株也可能對(duì)皮膚有好處,。”
研究人員召集了101位在校大學(xué)生,，其中49名患有痤瘡，52人的皮膚干凈,，通過一種毛孔清潔條從他們鼻部采集細(xì)菌樣本,，然后分析這些細(xì)菌的宏基因組，尋找微生物基因中的模式和變異,。
通過生物信息學(xué)技術(shù),，研究人員分離出了1000種痤瘡丙酸桿菌品種,，之后他們又將其分成10種類型，其中6種在痤瘡患者皮膚上十分常見,，另外還有一種在健康皮膚上反復(fù)被發(fā)現(xiàn),。
李慧穎表示，這說明關(guān)鍵是分析痤瘡丙酸桿菌的品種,，而不是將其作為一個(gè)整體來研究,。并且他她也指出，這是迄今為止發(fā)現(xiàn)的最多品種的皮膚微生物,，“尋找細(xì)菌菌種水平,，依然很難，但這也很重要,，因?yàn)檎缥覀兊难芯拷Y(jié)果表明,，并不是所有的菌株都是有害的，也并不是所有的菌株都是無害的,。”
為了更好的解析它們的遺傳差異,，這一研究組分離出了66個(gè)之前未識(shí)別的菌株，然后再次進(jìn)行高通量DNA測(cè)序分析,。
將這些所得的基因組與之前測(cè)序完成的基因組進(jìn)行比對(duì)——早在2004年,，德國研究人員就已經(jīng)完成了痤瘡丙酸桿菌(Propionibacterium acnes)基因組的測(cè)序工作，相關(guān)文章發(fā)表在最新一期的Science上,。
由此研究人員發(fā)現(xiàn)與痤瘡有關(guān)的兩種菌株,，其基因組中包含有能導(dǎo)致皮膚疾病的基因，而且那些存在于干凈皮膚上的菌株則具有能組織病毒感染的遺傳組成,。這也許正是為何有些痤瘡丙酸桿菌反而能令皮膚保持健康的原因所在,。
下一步研究人員將進(jìn)一步地研究菌株的差異，嘗試?yán)梦⑸鷳B(tài)調(diào)節(jié)劑治療痤瘡,，或者更有可能開發(fā)出相關(guān)的疫苗,，以及針對(duì)有害細(xì)菌菌株的護(hù)膚液或藥物。
來自紐約大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Martin Blaser對(duì)這一研究成果評(píng)論道,，“這是一項(xiàng)杰出的研究——這項(xiàng)研究做得非常地細(xì)致,，它設(shè)法解決人體微生物群系中一個(gè)重要的微生物，并取得了一些很有意義的結(jié)果,。”(生物谷Bioon.com)
doi:10.1038/jid.2013.21.
PMC:
PMID:
Propionibacterium acnes Strain Populations in the Human Skin Microbiome Associated with Acne.
Fitz-Gibbon S, Tomida S, Chiu BH, Nguyen L, Du C, Liu M, Elashoff D, Erfe MC, Loncaric A, Kim J, Modlin RL, Miller JF, Sodergren E, Craft N, Weinstock GM, Li H.
The human skin microbiome has important roles in skin health and disease. However, bacterial population structure and diversity at the strain level is poorly understood. We compared the skin microbiome at the strain level and genome level of Propionibacterium acnes, a dominant skin commensal, between 49 acne patients and 52 healthy individuals by sampling the pilosebaceous units on their noses. Metagenomic analysis demonstrated that although the relative abundances of P. acnes were similar, the strain population structures were significantly different in the two cohorts. Certain strains were highly associated with acne, and other strains were enriched in healthy skin. By sequencing 66 previously unreported P. acnes strains and comparing 71 P. acnes genomes, we identified potential genetic determinants of various P. acnes strains in association with acne or health. Our analysis suggests that acquired DNA sequences and bacterial immune elements may have roles in determining virulence properties of P. acnes strains, and some could be future targets for therapeutic interventions. This study demonstrates a previously unreported paradigm of commensal strain populations that could explain the pathogenesis of human diseases. It underscores the importance of strain-level analysis of the human microbiome to define the role of commensals in health and disease.
