在國際干細胞研究組織(International Stem Cell Initiative, ISCI)倡導下，來自中國,、英國,、新加坡、伊朗,、美國,、以色列、瑞士,、瑞典,、韓國、澳大利亞,、捷克,、巴西、印度,、日本,、俄羅斯、比利時,、加拿大,、荷蘭和芬蘭等十九個國家的人胚胎干細胞科學家攜手合作，開展了一項全世界最大規(guī)模的人胚胎干細胞遺傳變異研究,。
在英國著名干細胞專家Peter Andrews博士帶領下,，研究者針對125株人胚胎干細胞的基因組完整性進行了系統(tǒng)的分析。結果表明,，這些具有自我更新和分化全能性的細胞在體外長期培養(yǎng)過程中會出現(xiàn)許多共有的遺傳突變,、缺失和擴增，其中4個特定染色體1號,、12號,、17號,、以及20號最容易產(chǎn)生變異。進一步的研究還揭示了第20條染色體長臂上的一段DNA序列擴增頻率最高,，并鎖定了該區(qū)域內的單個候選基因BCL2L1,，突變后過度表達BCL2L1的細胞在培養(yǎng)中逐漸擁有生長優(yōu)勢。
中科院上海生命科學研究院健康所金穎研究員課題組與瑞金醫(yī)院馮云教授開展合作研究,，已建立7株人胚胎干細胞系（其中3株是在無動物源成分的條件下建立的）,，并已向國內外多家研究機構和課題組提供人胚胎干細胞系。所建立的中國人種胚胎干細胞系SHhES1和SHhES2參加了這項國際百株人胚胎干細胞遺傳變異研究,。這些寶貴的細胞資源既豐富了研究的覆蓋面,，同時研究數(shù)據(jù)本身也為進一步分析，并向國際干細胞研究組織提供了培養(yǎng)過程中中國人種特異的遺傳突變提供了可能,。
人胚胎干細胞最誘人的前景和用途是為細胞移植提供無免疫原性的分化細胞,。然而，在長期的培養(yǎng)過程中發(fā)現(xiàn),，各種細胞遺傳突變在體外不斷被報道,。一方面提示我們要優(yōu)化現(xiàn)有的培養(yǎng)環(huán)境，另一方面通過對針對類似BCL2L1基因的相關靶向檢測,，發(fā)現(xiàn)更好的技術來快速鑒別培養(yǎng)基中惡變的細胞,，這樣才能為人胚胎干細胞的臨床應用提供可能。
本項研究的成果已于11月28日發(fā)表于國際頂尖學術雜志《自然－生物技術》,。相對于之前的研究,，本項研究是到目前為止已經(jīng)發(fā)表的人胚胎干細胞領域規(guī)模最大的全球合作項目，研究所產(chǎn)生的寶貴數(shù)據(jù)資源以及參加研究的各個人胚胎干細胞株都將提供給全世界的科學家共享,。除金穎研究員本人外，該課題組孫博文博士,、李春亮博士和馬煜同學為此項研究做出重要貢獻,，并成為該篇研究論文的共同作者。（生物谷Bioon.com）
doi:10.1038/nbt.2051
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Screening ethnically diverse human embryonic stem cells identifies a chromosome 20 minimal amplicon conferring growth advantage
Sun Bowen, Li Chunliang, Ma Yu, Ying Jin
he International Stem Cell Initiative analyzed 125 human embryonic stem (ES) cell lines and 11 induced pluripotent stem (iPS) cell lines, from 38 laboratories worldwide, for genetic changes occurring during culture. Most lines were analyzed at an early and late passage. Single-nucleotide polymorphism (SNP) analysis revealed that they included representatives of most major ethnic groups. Most lines remained karyotypically normal, but there was a progressive tendency to acquire changes on prolonged culture, commonly affecting chromosomes 1, 12, 17 and 20. DNA methylation patterns changed haphazardly with no link to time in culture. Structural variants, determined from the SNP arrays, also appeared sporadically. No common variants related to culture were observed on chromosomes 1, 12 and 17, but a minimal amplicon in chromosome 20q11.21, including three genes expressed in human ES cells, ID1, BCL2L1 and HM13, occurred in >20% of the lines. Of these genes, BCL2L1 is a strong candidate for driving culture adaptation of ES cells.
