隨著質(zhì)譜技術(shù)的日益成熟,，MS在蛋白質(zhì)組研究方面的應(yīng)用已經(jīng)越來越廣泛,。當(dāng)大量的蛋白通過2D-gel電泳分離后，質(zhì)譜技術(shù)在識別每個蛋白的真實身份起到越來越重要的作用,。最普遍的質(zhì)譜蛋白識別技術(shù)被稱為Peptide mass fingerprint,，這種技術(shù)主要被用于通過2D-gel電泳分離的蛋白，經(jīng)過特異性氨基酸識別位點的蛋白酶切后,，產(chǎn)生的多肽片斷通過質(zhì)譜測定其分子量,，那么就可以利用這些多肽的分子量同蛋白質(zhì)公共數(shù)據(jù)庫中的所有蛋白，在計算機上經(jīng)過同樣特異性蛋白酶切后,，產(chǎn)生的多肽的理論計算得的分子量進行比較,，獲得一系列的最佳的匹配的蛋白質(zhì)，縮小蛋白識別的范圍,，從而最終可能獲得一致的蛋白質(zhì),。

本文介紹了如何通過從質(zhì)譜所獲得的多肽信息來進行蛋白質(zhì)識別。這篇文章描述了利用貝葉斯算法，通過建立理論蛋白質(zhì)酶切的多肽數(shù)據(jù)庫以及相應(yīng)的蛋白質(zhì)搜索引擎，進行蛋白質(zhì)識別。