本文比較了兩個著名的數(shù)據(jù)庫pfam和MEROPS。兩者都是蛋白家族數(shù)據(jù)庫,，不同的是pfam是基于HMM模型構(gòu)建并拓展的,，因此它覆蓋了幾乎所有已知的蛋白質(zhì)家族和Domain,，非常全面,，而MEROPS是一個特定的對蛋白水解酶家族進(jìn)行分類的專業(yè)數(shù)據(jù)庫，分類精細(xì),。這兩個二級數(shù)據(jù)庫在全世界范圍內(nèi)被研究者廣泛的使用著,。通過系統(tǒng)比較兩個數(shù)據(jù)庫的內(nèi)容，作者希望達(dá)到這樣兩個目的：其一,、找到兩個數(shù)據(jù)庫中缺失的和假陽性的部分,，提高兩個數(shù)據(jù)庫的質(zhì)量，其二,、看看兩者在定義蛋白質(zhì)家族方面有多少一致性,。