本文比較了兩個(gè)著名的數(shù)據(jù)庫(kù)pfam和MEROPS,。兩者都是蛋白家族數(shù)據(jù)庫(kù),，不同的是pfam是基于HMM模型構(gòu)建并拓展的,，因此它覆蓋了幾乎所有已知的蛋白質(zhì)家族和Domain，非常全面,，而MEROPS是一個(gè)特定的對(duì)蛋白水解酶家族進(jìn)行分類的專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù),，分類精細(xì),。這兩個(gè)二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)在全世界范圍內(nèi)被研究者廣泛的使用著。通過系統(tǒng)比較兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的內(nèi)容,，作者希望達(dá)到這樣兩個(gè)目的：其一,、找到兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中缺失的和假陽(yáng)性的部分，提高兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的質(zhì)量,，其二,、看看兩者在定義蛋白質(zhì)家族方面有多少一致性。