瑞典的蛋白組研究人員計劃于近日發(fā)布一個數據庫,,其中包括幾千張人類細胞和組織中各種蛋白質的圖片,。這個數據庫被稱為“蛋白質圖集”,目的是協(xié)助生物化學家識別新發(fā)現(xiàn)的蛋白質的功能。
瑞典斯德哥爾摩皇家技術研究院的微生物學家、“蛋白質圖集”項目負責人Mathias Uhlén指出,從20世紀90年代起,,科學家們開始測定人類基因序列,確定每個基因編碼的蛋白質在細胞中的位置成為當務之急,。他說,,圖集能通過提供有關蛋白質功能的線索,推動它們成為疾病標志或藥物靶物質,。兩年前的一次小規(guī)模試驗使瑞典Knut和Alice Wallenberg基金會決定,,為一個持續(xù)到2007年9月的大規(guī)模“蛋白質圖集”計劃提供資助。
為了確定蛋白質在人體組織內的定位,,Uhlén小組的100多名科學家將這個問題分成兩部分——找到每種蛋白質的抗體,,然后利用抗體尋找組織內的蛋白質。Uhlén小組創(chuàng)造出一系列標準物,,其中含有48種正常人體組織和20種腫瘤組織的微樣品,,這樣可以使研究過程變成流水作業(yè)。給抗體作好標記,,以便弄清每種組織中所表達的蛋白質,。盡管這套新圖集目前只包括大約700種蛋白質,但研究小組將繼續(xù)添加22000種左右的蛋白質,,每個人類基因對應一種蛋白質,。
美國耶魯大學的Michael Snyder正在領導一個大規(guī)模酵母蛋白定位計劃,他表示:“這是你能得到的最有價值的數據庫之一,。”在判斷蛋白質是位于細胞核,、細胞膜還是其他部位的過程中,酵母菌的數據庫已被證明是一種縮小定位范圍的必要工具,。
“蛋白質圖集”還有些地方需要確認,。如果抗體與一種以上的蛋白質反應,組織定位可能會無意中指向其他蛋白質,。Uhlén小組將另請專家來解決這個問題,。