瑞典的蛋白組研究人員計劃于近日發(fā)布一個數(shù)據(jù)庫,,其中包括幾千張人類細胞和組織中各種蛋白質(zhì)的圖片,。這個數(shù)據(jù)庫被稱為“蛋白質(zhì)圖集”,目的是協(xié)助生物化學(xué)家識別新發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)的功能,。
瑞典斯德哥爾摩皇家技術(shù)研究院的微生物學(xué)家、“蛋白質(zhì)圖集”項目負責(zé)人Mathias Uhlén指出,從20世紀(jì)90年代起,,科學(xué)家們開始測定人類基因序列,,確定每個基因編碼的蛋白質(zhì)在細胞中的位置成為當(dāng)務(wù)之急。他說,,圖集能通過提供有關(guān)蛋白質(zhì)功能的線索,,推動它們成為疾病標(biāo)志或藥物靶物質(zhì)。兩年前的一次小規(guī)模試驗使瑞典Knut和Alice Wallenberg基金會決定,,為一個持續(xù)到2007年9月的大規(guī)模“蛋白質(zhì)圖集”計劃提供資助,。
為了確定蛋白質(zhì)在人體組織內(nèi)的定位,Uhlén小組的100多名科學(xué)家將這個問題分成兩部分——找到每種蛋白質(zhì)的抗體,,然后利用抗體尋找組織內(nèi)的蛋白質(zhì),。Uhlén小組創(chuàng)造出一系列標(biāo)準(zhǔn)物,其中含有48種正常人體組織和20種腫瘤組織的微樣品,,這樣可以使研究過程變成流水作業(yè),。給抗體作好標(biāo)記,以便弄清每種組織中所表達的蛋白質(zhì),。盡管這套新圖集目前只包括大約700種蛋白質(zhì),,但研究小組將繼續(xù)添加22000種左右的蛋白質(zhì),每個人類基因?qū)?yīng)一種蛋白質(zhì),。
美國耶魯大學(xué)的Michael Snyder正在領(lǐng)導(dǎo)一個大規(guī)模酵母蛋白定位計劃,,他表示:“這是你能得到的最有價值的數(shù)據(jù)庫之一。”在判斷蛋白質(zhì)是位于細胞核,、細胞膜還是其他部位的過程中,,酵母菌的數(shù)據(jù)庫已被證明是一種縮小定位范圍的必要工具。
“蛋白質(zhì)圖集”還有些地方需要確認,。如果抗體與一種以上的蛋白質(zhì)反應(yīng),,組織定位可能會無意中指向其他蛋白質(zhì)。Uhlén小組將另請專家來解決這個問題,。