從胚胎和成人中獲得的干細(xì)胞也許不是像人們想象的那樣通過(guò)產(chǎn)生新的、多能性的細(xì)胞來(lái)使受損組織再生的,。它的作用原理我們了解得還十分不夠,，這一論述發(fā)表在2005年8月的《干細(xì)胞和發(fā)展》（Stem  Cells  and  Development）雜志上（這是由Mary  Ann  Liebert公司發(fā)行的一本同行評(píng)論性質(zhì)的雜志）,。

        目前干細(xì)胞在心臟、大腦和肺部疾病的治療方面都顯示良好效果,。但是,，最近來(lái)自印地安那大學(xué)和斯坦福大學(xué)等研究所的越來(lái)越多的研究顯示干細(xì)胞不是通過(guò)轉(zhuǎn)分化*來(lái)再生組織的。一直以來(lái),，都認(rèn)為干細(xì)胞是通過(guò)轉(zhuǎn)分化對(duì)疾病進(jìn)行治療的,，但是越來(lái)越多證據(jù)顯示干細(xì)胞沒(méi)有發(fā)生轉(zhuǎn)分化。

        *生物谷注：一種類型分化的細(xì)胞轉(zhuǎn)變成另一種類型的分化細(xì)胞現(xiàn)象稱轉(zhuǎn)分化（transdifferentiation）,。

        事實(shí)上干細(xì)胞治療仍是一種十分有希望的治療方式,。但是它的作用模式遠(yuǎn)比我們想像中復(fù)雜，是一種我們從未認(rèn)識(shí)到的作用模式,。有人認(rèn)為,，干細(xì)胞分化成為其它功能細(xì)胞是由于蛋白表達(dá)水平不同而造成的，而不是由于有新的蛋白被表達(dá),。

        同時(shí),，有人提出新的干細(xì)胞作用原理假說(shuō)。干細(xì)胞之所以可以對(duì)一些神經(jīng)損傷進(jìn)行治療是因?yàn)樗ㄟ^(guò)減弱炎癥反應(yīng)阻止了在最初損傷后在大腦和脊髓中持續(xù)性的級(jí)聯(lián)反應(yīng),。