流行性感冒每年造成36,000以上的美國(guó)人死亡,，因此進(jìn)一步了解這種疾病是相當(dāng)有必要的,。
研究人員公布超過(guò)200種人類流行性感冒病毒株的基因序列,。這項(xiàng)信息將共享于數(shù)據(jù)庫(kù)中,，可幫助科學(xué)家更了解流感病毒的演化、傳播和致疾機(jī)制,。
新發(fā)表的基因組資料讓科學(xué)家確定,，為什么目前的流行性感冒疫苗無(wú)法充分地保護(hù)接種的個(gè)體免于感染。
研究報(bào)告將發(fā)表于10月5日Nature的網(wǎng)絡(luò)版,。這項(xiàng)新數(shù)據(jù)可以給與科學(xué)家最完整的圖信息,，了解流行性感冒病毒的演化和在人類之間的傳遞。同時(shí)也能幫助制藥公司研發(fā)出更有效的疫苗,、治療方法和診斷方式,。
這項(xiàng)研究完整地將209株流感病毒定序，確定了超過(guò)2百8十萬(wàn)個(gè)核苷酸堿基,。
在2005—2006年流感流行季節(jié)前夕,美國(guó)基因組研究所(TIGR)的科學(xué)家找到了流感病毒基因組在不斷進(jìn)化的證據(jù),。他們將這一首次大規(guī)模流感病毒測(cè)序的研究結(jié)果10月5日在線發(fā)表在Nature雜志上。
該研究證明在人群中流行的流感病毒在迅速進(jìn)化,研究者還提出了監(jiān)測(cè)流感病毒的新策略,。
流感病毒長(zhǎng)期存在于人類社會(huì),即使在普遍接種流感疫苗的人群,甲型流感病毒也十分猖獗,并且是導(dǎo)致人類患病和死亡的重要原因,。流感病毒每年變異,導(dǎo)致疫苗失效,需不斷選擇新的病毒株來(lái)制備疫苗。如果病毒發(fā)生抗原性轉(zhuǎn)變(antigenic shift),則人群對(duì)新病毒株缺乏免疫力,即導(dǎo)致全球大流行,。發(fā)生在20世紀(jì)的3次流感大流行(1918年,、1957年和1968年)死亡人數(shù)就達(dá)數(shù)千萬(wàn)。
雖然1933年人類就分離出了第一株流感病毒,但對(duì)流感病毒是如何進(jìn)化的還是不完全清楚,。為更好地了解流感病毒的進(jìn)化,在過(guò)去5個(gè)流感季節(jié)(1999—2004年),TIGR的科學(xué)家測(cè)定了209株流感病毒的全部基因組序列(包括2821103個(gè)核苷酸),并對(duì)其基因組進(jìn)行比較,。這些甲型流感病毒株是從美國(guó)紐約州流感病人中分離獲得的,其中207株為H3N2,2株為H1N2。
該研究顯示,在5年研究期間,紐約州至少有3種H3N2亞群,在一些流感流行季節(jié),這3種變異病毒同時(shí)存在,即人群患病類似,但感染的病毒不同,。TIGR病毒基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室主任Ghedin說(shuō),即使在這一相對(duì)較小的地理區(qū)域內(nèi),流感病毒的變化也呈現(xiàn)顯著的多樣性,變異病毒發(fā)生了遺傳物質(zhì)交換,。
該研究證明,這些變異株是流感病毒可以利用的遺傳資源庫(kù),一小群流感病毒株在局部傳播,并向不同方向進(jìn)化,如一株與另一株混合即出現(xiàn)新的優(yōu)勢(shì)病毒株。該研究報(bào)告的全部序列已輸入公共數(shù)據(jù)庫(kù)(例如GenBank),科學(xué)家可以隨時(shí)查閱,。
在每個(gè)流感季節(jié),全球的科學(xué)家都試圖確定流行的優(yōu)勢(shì)流感病毒株,并將優(yōu)勢(shì)株列入下一個(gè)流感季節(jié)的疫苗研制之中,。但因?yàn)榱鞲胁《驹诓粩噙M(jìn)化,預(yù)測(cè)工作非常困難。目前,基因組學(xué)成為研究流感病毒進(jìn)化的新熱點(diǎn),。通過(guò)破譯不同流感病毒株的基因組密碼,科學(xué)家可以準(zhǔn)確確定發(fā)生變異的部位,這些變異使病毒的毒性增加,使其能夠感染新的物種或逃避免疫應(yīng)答,。研究人員指出,基因組研究可幫助人們更好地跟蹤流感病毒,開(kāi)發(fā)更有效的疫苗。
9月22日出版的Nature雜志以“Flu researchers slam US agency for hoarding data”為題,，說(shuō)明了近期美國(guó)疾病控制中心（CDC）封鎖了他們的研究,，其它流感專家已經(jīng)很難從CDC獲得研究數(shù)據(jù)這一另人費(fèi)解的情況。
之前布什總統(tǒng)還在關(guān)于新奧爾良颶風(fēng)影響的發(fā)言中呼吁建立一個(gè)各國(guó)聯(lián)合對(duì)抗禽流感（分享WHO世衛(wèi)組織的禽流感信息和樣品）的國(guó)際聯(lián)盟,，但是通過(guò)Nature的調(diào)查,，發(fā)現(xiàn)位于美國(guó)亞特蘭大的CDC中心流感組沒(méi)有把他們已知的禽流感病毒序列以及免疫學(xué)流行病學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)公布，因此阻延了禽流感研究,。雖然現(xiàn)行的政策規(guī)定,，在每一次流感來(lái)襲之前所生產(chǎn)的疫苗的全部數(shù)據(jù)是不會(huì)公開(kāi)的，但來(lái)自美國(guó)休斯頓的Rice大學(xué)物理學(xué)家Michael Deem認(rèn)為這一政策是不合理的,，應(yīng)該廢止,，他這一看法獲得了許多科學(xué)家的贊同。一位進(jìn)化生態(tài)學(xué)家表示,，CDC所做的工作十分重要,，但是要從他們那兒獲得數(shù)據(jù)資料真是相當(dāng)?shù)睦щy的一件事。研究人員目前并不確定CDC到底有多少流感病毒序列相關(guān)數(shù)據(jù),，但是一位來(lái)自NIH的生物信息學(xué)家說(shuō)除了那些通過(guò)雜志發(fā)表的之外,，CDC的數(shù)據(jù)“coming through an eye dropper”（說(shuō)明數(shù)據(jù)公布之慢,，生物谷注）。Nature的分析家同意這一看法——就連在Genebank的和在新墨西哥Los Alamos國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的大約15,000個(gè)流感序列都還沒(méi)有到CDC數(shù)據(jù)的十分之一,。
CDC病毒與立克次體疾?。╲iral and rickettsial diseases）研究組主任James LeDuc也承認(rèn)分享數(shù)據(jù)是十分的重要，但是表示CDC不能滿足所有索要信息的要求,。然而研究人員認(rèn)為CDC應(yīng)該更加努力的滿足科研的要求,，因?yàn)樽鳛橐环N最近侵襲了亞洲、俄羅斯和哈薩克斯坦（Kazakhstan）的疾病,，禽流感如果沒(méi)有更有效的疫苗被研制出來(lái),，可能會(huì)成為新一輪的流感災(zāi)難。（生物通記者：張迪）
