從20日起,,世界各地的研究人員都可以在日本理化研究所的網(wǎng)站上,,瀏覽流感病毒表面蛋白神經(jīng)氨酸酶1500多個種類的立體構(gòu)造預(yù)測數(shù)據(jù)。
神經(jīng)氨酸酶是流感病毒增殖不可缺少的蛋白質(zhì),,也是許多抗流感藥物攻擊病毒的“靶子”,。著名的抗流感藥達菲就是通過阻礙神經(jīng)氨酸酶的活性而發(fā)揮作用的。神經(jīng)氨酸酶大體分為N1至N9共9大類,,但是根據(jù)其氨基酸序列的微小差異可以進一步細分為1603個種類,其中能夠感染人類的N1型和N2型約占80%,。
日本理化研究所的研究人員介紹說,,他們從美國收集的組成蛋白質(zhì)的氨基酸序列數(shù)據(jù)庫中調(diào)取和神經(jīng)氨酸酶相關(guān)的氨基酸序列數(shù)據(jù),輸入預(yù)測蛋白質(zhì)立體構(gòu)造的電腦軟件,。在參照利用X射線已經(jīng)完成解析的約70種神經(jīng)氨酸酶構(gòu)造的基礎(chǔ)上,,研究人員預(yù)測出了剩余1500多種神經(jīng)氨酸酶的立體構(gòu)造。相關(guān)數(shù)據(jù)已被加工成數(shù)據(jù)庫,,刊登在理化研究所的網(wǎng)站上,。
以往利用X射線解析蛋白質(zhì)立體構(gòu)造,,平均解析一種就要耗時3個月以上。而利用理化研究所開發(fā)的軟件,,只要掌握氨基酸序列,,平均90分鐘就能預(yù)測一種神經(jīng)氨酸酶的立體構(gòu)造。
日本北里大學(xué)藥學(xué)系教授,、理化研究所特聘研究員梅山秀明說,,“我們期待向全世界研究人員公開神經(jīng)氨酸酶立體構(gòu)造數(shù)據(jù)能促進新型治療藥物的開發(fā),并縮短開發(fā)時間,。”梅山秀明說,,一旦禽流感病毒變異成能在人際傳播的新型流感病毒,理化研究所的數(shù)據(jù)將有助于研究人員迅速開發(fā)出針鋒相對的治療藥物,。