雖然目前科學(xué)家們已經(jīng)知道人類基因組中包含著成千上萬(wàn)的microRNA(miRNA),,而且這些miRNAs可以調(diào)節(jié)許多mRNA的翻譯,,但是這些miRNAs對(duì)組織特異mRNA的整體作用還未得到系統(tǒng)的闡述。近期來(lái)自紐約大學(xué)比較功能基因組學(xué)中心的研究人員分析發(fā)現(xiàn)由幾個(gè)高組織特異性miRNAs靶定的mRNA會(huì)根據(jù)miRNAs存在與否改變其表達(dá)水平,,這證明了miRNA對(duì)組織特異性mRNA的影響,,也提供了一種新的分析miRNA3’UTR的工具,。這一研究成果公布在2月21日的PNAS雜志上。
miRNAs是一種21-25nt長(zhǎng)的單鏈小分子RNA,,參與了生命過(guò)程中一系列的重要進(jìn)程,,包括發(fā)育進(jìn)程,造血過(guò)程,,器官形成,,凋亡,細(xì)胞增殖,,甚至是腫瘤發(fā)生,。這一小RNA的一個(gè)重要特點(diǎn)是細(xì)胞特異性或組織特異性,比如說(shuō)擬南芥中的miR-171僅在其花序中高水平表達(dá),,在某些組織低水平表達(dá),,在莖、葉等組織中卻無(wú)任何表達(dá)的跡象,;20-24h的果蠅胚胎提取物中可發(fā)現(xiàn)miR-12,,卻找不到miR3-miR6,在成年果蠅中表達(dá)的miR-1和let-7也無(wú)法在果蠅胚胎中表達(dá),。但是這一特異性至今為止并未得到完整闡述,。
紐約大學(xué)Pranidhi Sood等人通過(guò)一種計(jì)算機(jī)分析工具將當(dāng)miRNA過(guò)量表達(dá)或者敲除的時(shí)候,mRNA水平多少的變化與3’UTR聯(lián)系在一起,,發(fā)現(xiàn)在相同組織中,,高組織特異的miRNAs的作用靶目標(biāo)——mRNA表達(dá)水平會(huì)比組織中沒(méi)有這種miRNA的時(shí)候低。相反,,高表達(dá)基因轉(zhuǎn)錄出很多mRNAs,,但這些mRNA并沒(méi)有在同樣組織中的miRNAs識(shí)別位點(diǎn)。
(生物通記者:張迪)