許多研究發(fā)現(xiàn),,saltans果蠅和willistoni果蠅很少使用GC作為終止密碼子,,內(nèi)含子中也很少含有GC堿基對。關(guān)于這種模式有兩種解釋,,一種認(rèn)為是突變形成的,,一種認(rèn)為這兩種果蠅的偏愛密碼子和非偏愛密碼子本來就與眾不同。
為了對此問題有深一步了解,,研究人員在saltans/willistoni果蠅中,,利用無活性的Q-樣逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(Q-like retrotransposable element)對背景替換模式(background substitutional patterns,生物通編者譯)進(jìn)行定量分析,。發(fā)現(xiàn),,saltans/willistoni果蠅背景替換模式變化很大,主要是因為突變偏愛性的改變,。這些差異提示saltans/willistoni果蠅與melanogaster等果蠅相比,,基因組中所含的GC堿基對少很多,差異主要是內(nèi)含子GC含量高的主要原因,,但不足以解釋saltans/willistoni果蠅與其它果蠅相比,,為何密碼子偏愛性發(fā)生改變。
研究人員推測,,saltans/willistoni果蠅密碼子使用頻率的改變可能是種屬的偏愛密碼子和非偏愛密碼子具有特異性,,也可能是saltans/willistoni果蠅密碼子偏愛性的不牢固選擇壓力所致。
研究結(jié)果刊登于10月18日電子版《BMC Biology》,。